Przejdź do zawartości
Merck

Analiza strukturalna białek

Trójwymiarowa ilustracja złożonej struktury białka z przeplatającymi się wstążkami w różnych kolorach reprezentującymi składanie łańcuchów aminokwasów.

Funkcja białka jest bezpośrednio zależna od jego struktury, interakcji z innymi białkami oraz lokalizacji w komórkach, tkankach i narządach. Struktura i funkcja białek jest badana na dużą skalę w proteomice, która umożliwia identyfikację biomarkerów białkowych związanych z określonymi stanami chorobowymi i zapewnia potencjalne cele leczenia terapeutycznego. Zrozumienie struktury białek i mapowanie ich lokalizacji, poziomów ekspresji i interakcji dostarcza cennych informacji, które można wykorzystać do wnioskowania o funkcji białek.

- Struktura białek
- Określanie struktury białek
- Mapowanie białek


Powiązane artykuły techniczne

Powiązane protokoły

  • This page covers the principles and methods of chromatofocusing, a chromatography technique that separates proteins according to differences in their isoelectric point (pI).
  • Protein Structural Analysis
  • This protocol describes a method for chemical cross-linking of proteins using formaldehyde. With the exception of zero-length cross-linkers, formaldehyde has the shortest cross-linking span (~2-3 Å) of any cross-linking reagent, thus making it an ideal tool for detecting specific protein-protein interactions with great confidence.
  • Zobacz wszystkie (2)

Znajdź więcej artykułów i protokołów


Struktura białka

Struktura białka jest określana przez sekwencję aminokwasów, które składają się na białko i sposób, w jaki białko składa się w bardziej złożone kształty.

  • Struktura podstawowa jest definiowana przez sekwencję aminokwasów białka.
  • Struktura drugorzędowa jest definiowana przez lokalne interakcje odcinków łańcucha polipeptydowego, które mogą tworzyć α-heliksy i β-sheets poprzez interakcje wiązań wodorowych.
  • Struktura trzeciorzędowa definiuje ogólną trójwymiarową strukturę białka.
  • Struktura czwartorzędowa określa, w jaki sposób wiele podjednostek białka oddziałuje ze sobą, tworząc większe kompleksy.

Określanie struktury białek

Określanie trójwymiarowych struktur białek w rozdzielczości atomowej jest przydatne w wyjaśnianiu funkcji białek, projektowaniu leków opartych na strukturze i dokowaniu molekularnym.

  • NMR: Spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR) jest wykorzystywana do uzyskiwania informacji o strukturze i dynamice białek. W NMR przestrzenna lokalizacja atomów jest określana przez ich przesunięcia chemiczne. W przypadku NMR białka są zazwyczaj znakowane stabilnymi izotopami (15N, 13C, 2H) w celu zwiększenia czułości i ułatwienia dekonwolucji strukturalnej. Etykiety izotopowe są zwykle wprowadzane poprzez dostarczanie izotopowo znakowanych składników odżywczych do pożywki wzrostowej podczas ekspresji białka.
  • Krystalografia rentgenowska: Krystalografia rentgenowska białek może być stosowana do uzyskania trójwymiarowej struktury białek poprzez dyfrakcję rentgenowską skrystalizowanych białek. Kryształy są hodowane poprzez wysiewanie wysoce skoncentrowanego białka w roztworach, które promują wytrącanie, z uporządkowanymi kryształami białka tworzącymi się w odpowiednich warunkach. Promienie rentgenowskie są kierowane na kryształ białka, który rozprasza promienie rentgenowskie na detektorze elektronicznym lub filmie. Kryształy są obracane, aby uchwycić dyfrakcję w trzech wymiarach, umożliwiając obliczenie położenia każdego atomu w skrystalizowanej cząsteczce za pomocą transformaty Fouriera.

Mapowanie białek

Mapowanie lokalizacji i poziomu ekspresji białek w określonych komórkach, tkankach i narządach pomaga w funkcjonalnym badaniu proteomu. Przestrzenna dystrybucja białek jest kluczem do ich funkcji, a niewłaściwa lokalizacja lub ekspresja wywołuje różne stany chorobowe. Projekty mapowania, takie jak Human Protein Atlas, zapewniają zasoby proteomiczne do odkrywania biomarkerów i pomagają w zrozumieniu patologii chorób. Mapowanie interaktomu pomaga zdefiniować interakcje molekularne zachodzące na poziomie komórkowym, pomagając w zrozumieniu funkcji białek i zapewniając cenne potencjalne cele leków na choroby.


Powiązane zasoby dotyczące produktów

  • Bulletin: ISOGRO Media

    This technical bulletin is from ISOGRO Media, providing information on stable isotope enrichment of proteins for NMR spectroscopy.





Zaloguj się, aby kontynuować

Zaloguj się lub utwórz konto, aby kontynuować.

Nie masz konta użytkownika?