Atlas białek ludzkich

Atlas białek ludzkich został zainicjowany w 2003 roku w celu mapowania wszystkich białek ludzkich w komórkach, tkankach i narządach oraz dostarczania tych informacji w formacie otwartego dostępu w celu lepszego zrozumienia biologii człowieka i chorób. Podzielony na trzy podatlasy - Atlas tkanek, Atlas komórek i Atlas patologii - program opiera się na czułych i wysoce specyficznych przeciwciałach, aby zapewnić dokładne oszacowanie ekspresji białek. Wszystkie przeciwciała stosowane w Human Protein Atlas przechodzą rygorystyczny proces walidacji, który obejmuje analizę Western blot, barwienie immunohistochemiczne i ocenę immunofluorescencji w odniesieniu do starannie dobranych materiałów próbek. Nasze Prestige Antibodies^®, które udostępniliśmy komercyjnie poprzez nasze partnerstwo z Atlas Antibodies, są wspierane przez dane z Human Protein Atlas i reprezentują najlepiej scharakteryzowane przeciwciała pierwotne na rynku.

Trzy pod-atlasy Atlasu Białek Ludzkich

Atlas tkanek

.Przejrzyj wysokiej jakości barwienie tkanki docelowej, aby wybrać rygorystycznie zwalidowane przeciwciała

Atlas tkanek zawiera informacje dotyczące profili ekspresji ludzkich genów w różnych tkankach zarówno na poziomie białka, jak i mRNA. Dane dotyczące ekspresji białek opierają się na analizie immunohistochemicznej 76 różnych typów komórek, odpowiadających 44 normalnym typom tkanek ludzkich, podczas gdy dane dotyczące ekspresji mRNA pochodzą z głębokiego sekwencjonowania RNA (RNA-seq) z 37 normalnych typów tkanek. Informacje te można łatwo zbadać, wyszukując określony gen. Na przykład, białko PAX8 ulega ekspresji w tkankach, które obejmują tarczycę i nerki, a wzbogaconą ekspresję obserwuje się w tych samych tkankach na poziomie mRNA.

Oprócz przeszukiwania Atlasu tkanek pod kątem konkretnego genu, możliwe jest również wyszukanie konkretnej tkanki ludzkiej. Może to dostarczyć cennych informacji, takich jak to, które geny wykazują podwyższoną ekspresję białka w tej tkance i czy ta ekspresja jest ograniczona do określonego regionu. Na przykład 130 genów wykazuje podwyższoną ekspresję w tkance piersi w porównaniu z innymi tkankami, a dogłębna analiza tych genów przy użyciu profilowania opartego na przeciwciałach ilustruje, że kilka kodowanych białek ulega wysokiej ekspresji w gruczołach sutkowych piersi w okresie laktacji. 

The Cell Atlas

Zbadaj barwienie na poziomie komórkowym, aby zidentyfikować przeciwciała istotne dla Twojego celu komórkowego<

Atlas komórkowy dostarcza informacji o przestrzennym rozkładzie białek w panelu 64 linii komórkowych, wybranych w celu reprezentowania różnych populacji komórek w różnych narządach ludzkiego ciała. Dane dotyczące ekspresji białek są generowane za pomocą mikroskopii immunofluorescencyjnej, podczas gdy dane dotyczące ekspresji mRNA pochodzą z głębokiego sekwencjonowania RNA. Podzbiór tych linii komórkowych jest poddawany głębszemu badaniu, w ramach którego subkomórkowa dystrybucja białek jest klasyfikowana do 33 różnych organelli i drobnych struktur komórkowych. Informacje te można zbadać, wyszukując określony gen. Na przykład, analiza immunocytochemiczna wykazuje, że białko PAX8 jest zlokalizowane w nukleoplazmie, podczas gdy dane dotyczące ekspresji mRNA, które są w pełni analizowane po posortowaniu linii komórkowych według ich narządów podobieństwa fenotypowego, wykazują zwiększoną ekspresję w tkankach, w tym w nerkach i piersiach.

Oprócz przeszukiwania Atlasu Komórek pod kątem konkretnego genu, możliwe jest również bardziej szczegółowe badanie różnych linii komórkowych i organelli komórkowych. Human Protein Atlas zestawił te informacje w różne zbiory danych, w tym następujące:

• Transkryptom linii komórkowych  - analiza transkryptomu 64 różnych linii komórkowych ujawnia geny o podwyższonej ekspresji w określonych liniach komórkowych oraz te geny, które ulegają ekspresji w liniach komórkowych, ale nie w odpowiadającej im normalnej tkance
• Organelle proteome - kompleksowe informacje dotyczące subkomórkowej lokalizacji białek
• Multilocalizing proteome - identyfikacja białek, które są zlokalizowane w więcej niż jednej organelli
• Białko zależne od cyklu komórkowego - analiza ujawnia białka wykazujące zmienność wzorców ekspresji między komórkami, nawet jeśli komórki te są genetycznie identyczne i pochodzą z tej samej populacji klonalnej

Atlas patologii

Zrozum, jak ekspresja białek różni się między tkankami prawidłowymi i nowotworowymi

Atlas patologii zawiera dane dotyczące ekspresji białek i mRNA dla najczęstszych form raka człowieka. Human Protein Atlas skorelował poziomy ekspresji mRNA ludzkich genów w tkance nowotworowej z wynikami klinicznymi dla około 8000 odpowiednich pacjentów z rakiem, a dla wielu z tych genów przeprowadzono analizę immunohistochemiczną równoważnych białek. Atlas patologii umożliwia naukowcom badanie poziomów ekspresji białek dla poszczególnych guzów każdego typu nowotworu. Na przykład barwienie PAX8 jest podwyższone w tkankach raka tarczycy, jajnika i endometrium.

 Prestige Antibodies^®, powered by Atlas Antibodies

Nasze Prestige Antibodies^®, powered by Atlas Antibodies, są wspierane przez dane z Human Protein Atlas i reprezentują najlepiej scharakteryzowane przeciwciała pierwotne na rynku. Z ponad 40 000 przeciwciał Prestige Antibodies^® w naszym portfolio, jest wysoce prawdopodobne, że mamy produkt, którego potrzebujesz, aby zapewnić udane barwienie immunologiczne.

Dane dotyczące walidacji immunohistochemicznej, immunocytochemicznej i Western blot można znaleźć na stronach poszczególnych produktów, wraz z linkami do odpowiednich sekcji na stronie Human Protein Atlas.