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臭化エチジウム 溶液

for fluorescence, ~1% in H₂O

• 別名: 3,8-ジアミノ-5-エチル-6-フェニルフェナントリジニウムブロミド, EtBr, 臭化ホミジウム
• 実験式（ヒル表記法）: C₂₁H₂₀BrN₃
• CAS番号: 1239-45-8
• 分子量: 394.31
• Beilstein: 3642536
• MDL番号: MFCD00011724
• UNSPSCコード: 12161505
• PubChem Substance ID: 57650684
• NACRES: NA.32

特性

• グレード: for fluorescence
• 濃度: ~1% in H₂O
• 蛍光検出: λ_ex 480 nm; λ_em 620 nm in H₂O; λ_ex 518 nm; λ_em 605 nm (bound to DNA); λ_ex 530 nm; λ_em 600 nm in 50 mM phosphate buffer pH 7.0 (upon binding to DNA)
• 適合性: suitable for fluorescence
• 保管温度: 2-8°C
• SMILES記法: [Br-].CC[n+]1c(-c2ccccc2)c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc14
• InChI: 1S/C21H19N3.BrH/c1-2-24-20-13-16(23)9-11-18(20)17-10-8-15(22)12-19(17)21(24)14-6-4-3-5-7-14;/h3-13,23H,2,22H2,1H3;1H
• InChI Key: ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N

詳細

アプリケーション

臭化エチジウム(EtBr)は、PAGEまたはアガロースゲル電気泳動で核酸の染色に最も一般的に使用されています。EtBrの蛍光は、二本鎖RNAに結合すると21倍に、二本鎖DNAに結合すると25倍に増加するため、低濃度(10 μg/mL)で染色する場合はバックグラウンドを脱色する必要がありません。臭化エチジウムは、核酸に対する蛍光分析で多数使用されています。一本鎖DNAと(強力ではないが)結合し、また三本鎖DNAと結合することが示されています。DNAに結合する能力があることから、EtBrはDNAポリメラーゼの阻害剤です。

生物化学的／生理学的作用

臭化エチジウムは二本鎖のDNAとRNAとにインターカレーションし、フレームシフト型変異原物質として作用します。生存細胞、アポトーシス細胞、および壊死細胞を区別するため、アクリジンオレンジと併用することもできます。

再構成

電気泳動後のゲルの染色に用いる場合は、ストック溶液を水で0.5 μg/mlに希釈して、15~30分間ゲルを浸漬します。通常、脱色の必要はありませんが、バックグラウンドを下げる必要がある場合は水に15分間浸漬します。染色後、UVライトボックス(波長254 nm)上でDNAのバンドを検出します。ゲルおよび泳動用バッファーに臭化エチジウムを0.5 μg/mlとなるよう添加しておくと、泳動終了後すぐにバンド検出を行なうことができます。

安全性情報

• ピクトグラム: GHS06,GHS08
• シグナルワード: Danger
• 危険有害性情報: H331,H341
• 注意書き: P202 - P261 - P271 - P280 - P304 + P340 + P311 - P308 + P313
• 危険有害性の分類: Acute Tox. 3 Inhalation - Muta. 2
• 保管分類コード: 6.1D - Non-combustible acute toxic Cat.3 / toxic hazardous materials or hazardous materials causing chronic effects
• WGK: nwg
• 引火点(°F): Not applicable
• 引火点(℃): Not applicable
• 個人用保護具 (PPE): Eyeshields, Faceshields, Gloves, type ABEK (EN14387) respirator filter