おすすめの製品
由来生物
Serratia marcescens
品質水準
フォーム
solution
比活性
10000 U/mL
包装
pkg of 1,000 U (10220566001 [10 U/μl])
pkg of 5,000 U (10656348001 [10 U/μl])
pkg of 5,000 U (11047639001 [40 U/μl])
メーカー/製品名
Roche
濃度
<0.1 % (w/w)
パラメーター
25 °C optimum reaction temp.
テクニック
electrophoresis: suitable
色
colorless
pH
7.0 (39 °F)
溶解性
water: miscible
適合性
suitable for molecular biology
アプリケーション
life science and biopharma
その他の活性
Endonucleases, none detected (up to 20 U with lambda-DNA)
Endonucleases, none detected (up to 20U with pBR 322-DNA )
輸送温度
dry ice
保管温度
−20°C
関連するカテゴリー
詳細
Sma Iは、配列*C°C*C↓GGGを認識し、平滑末端を持つ断片を産生します。
特異性
認識部位:*C °C*CGGG
*C °C*CGGG
制限部位:*C °C*C↓GGG
*C °C*C↓GGG
熱失活:Sma Iは、65°Cで15分間インキュベートすることで不活性化されます(100 U/μg DNAまで試験済み)。
*C °C*CGGG
制限部位:*C °C*C↓GGG
*C °C*C↓GGG
熱失活:Sma Iは、65°Cで15分間インキュベートすることで不活性化されます(100 U/μg DNAまで試験済み)。
アプリケーション
Sma Iはマクロ制限分析で使用されています。また、制限消化、アミド高速パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)における制限酵素混合物にも使用されています。
品質
非特異的エンドヌクレアーゼ活性がない
1 μgのλDNAを50 μLのSuRE/CutバッファーA中、過剰のSma Iを添加して16時間インキュベートします。酵素の単位数が酵素による特有の制限パターンに影響を与えないことは分析証明書に示されています。
エキソヌクレアーゼ活性がない
約5 μgの[3H]標識した仔牛胸腺DNAを3 μLのSma Iを用いて総容量100 μL中50 mM Tris-HCl、10 mM MgCl2、1 mMジチオエリスリトール、pH 約7.5において、+37°Cで4時間インキュベートします。本条件下で、分析証明書に示されているように、放射能の放出は検出されていません。
1 μgのλDNAを50 μLのSuRE/CutバッファーA中、過剰のSma Iを添加して16時間インキュベートします。酵素の単位数が酵素による特有の制限パターンに影響を与えないことは分析証明書に示されています。
エキソヌクレアーゼ活性がない
約5 μgの[3H]標識した仔牛胸腺DNAを3 μLのSma Iを用いて総容量100 μL中50 mM Tris-HCl、10 mM MgCl2、1 mMジチオエリスリトール、pH 約7.5において、+37°Cで4時間インキュベートします。本条件下で、分析証明書に示されているように、放射能の放出は検出されていません。
DNAプロファイル
各種DNAにおける切断部位数
- λ:3
- φX174:0
- Ad2:12
- M13mp7:0
- pBR322:0
- pBR328:0
- pUC18:1
- SV40:0
単位の定義
1ユニットは、総量25 μL(1×)のSuRE/CutバッファーAにおいて+25°C、1時間で1 μgのλDNAを完全に切断する酵素活性です。
保管および安定性
−25°C以下で保存しないこと
アナリシスノート
Compatible ends(共通な末端)
Sma Iは平滑末端と共通の末端を生成します。
アイソシゾマー
本酵素はCfr9 I、PspA I、Xma IおよびXmaC Iのアイソシゾマーです。
メチル化感受性
Sma Iは認識配列の3つのC残基の中央(°)で5-メチルシトシンによる阻害を受けませんが、他のC(*)で5-メチルシトシンにより、または認識配列(*C°C*C↓GGG)中の任意の位置で4-メチルシトシンにより活性が阻害されます。
インキュベーション温度
+25°C
PFGE試験済み
Sma Iはパルスフィールドゲル電気泳動(細菌の染色体)でテストされています。PFGE分析のためにアガロースに埋め込んだゲノムDNA(E. coli C 600)の切断については、酵素10 U/μg DNAおよび4時間のインキュベーションを推奨します。
Ligation and recutting(ライゲーション‐再切断)検定
1μgのλDNAを完全に消化して得られたSma I断片を、1 UのT4 DNAリガーゼを用いて10 μL中、66 mM Tris-HCI、5 mM MgCl2、5 mM ジチオエリスリトール、1 mM ATP、pH 7.5(+20°C時)において+25°C、16時間インキュベートした結果、1μgのλDNA断片の>80%が回収されます。
引き続きSma Iで再切断を行うと>80%のλDNA × Sma I断片の典型的なパターンが得られます。
Sma Iは平滑末端と共通の末端を生成します。
アイソシゾマー
本酵素はCfr9 I、PspA I、Xma IおよびXmaC Iのアイソシゾマーです。
メチル化感受性
Sma Iは認識配列の3つのC残基の中央(°)で5-メチルシトシンによる阻害を受けませんが、他のC(*)で5-メチルシトシンにより、または認識配列(*C°C*C↓GGG)中の任意の位置で4-メチルシトシンにより活性が阻害されます。
インキュベーション温度
+25°C
PFGE試験済み
Sma Iはパルスフィールドゲル電気泳動(細菌の染色体)でテストされています。PFGE分析のためにアガロースに埋め込んだゲノムDNA(E. coli C 600)の切断については、酵素10 U/μg DNAおよび4時間のインキュベーションを推奨します。
Ligation and recutting(ライゲーション‐再切断)検定
1μgのλDNAを完全に消化して得られたSma I断片を、1 UのT4 DNAリガーゼを用いて10 μL中、66 mM Tris-HCI、5 mM MgCl2、5 mM ジチオエリスリトール、1 mM ATP、pH 7.5(+20°C時)において+25°C、16時間インキュベートした結果、1μgのλDNA断片の>80%が回収されます。
引き続きSma Iで再切断を行うと>80%のλDNA × Sma I断片の典型的なパターンが得られます。
SuRE/Cutバッファーシステム
至適な活性のために太字で示されたバッファーを推奨します。
至適な活性のために太字で示されたバッファーを推奨します。
- A:100%
- B:0~10%
- H:0~10%
- L:0~10%
- M:0~10%
PCRバッファー中の活性:100%
PCR mix(Taq DNAポリメラーゼバッファー)中の相対活性は100%です。PCR mixはλDNA、プライマー、10 mM Tris-HCl(pH 8.3、20°C)、50 mM KCl、1.5 mM MgCl2、200 μM dNTP、2.5 U Taq DNAポリメラーゼを含みます。混合液は25サイクルの増幅反応にかけられました。PwoSuperYield DNAポリメラーゼPCR Mixの反応バッファー中の活性は100%です。GCリッチ溶液を追加しても活性は100%を維持します。Pwo SuperYield DNAポリメラーゼPCR Mixは米国では入手できません。
PCR mix(Taq DNAポリメラーゼバッファー)中の相対活性は100%です。PCR mixはλDNA、プライマー、10 mM Tris-HCl(pH 8.3、20°C)、50 mM KCl、1.5 mM MgCl2、200 μM dNTP、2.5 U Taq DNAポリメラーゼを含みます。混合液は25サイクルの増幅反応にかけられました。PwoSuperYield DNAポリメラーゼPCR Mixの反応バッファー中の活性は100%です。GCリッチ溶液を追加しても活性は100%を維持します。Pwo SuperYield DNAポリメラーゼPCR Mixは米国では入手できません。
その他情報
ライフサイエンス研究専用。診断目的での使用はできません。
キットの構成要素のみ
製品番号
詳細
- Enzyme Solution
- SuRE/Cut Buffer A 10x concentrated
保管分類コード
12 - Non Combustible Liquids
WGK
WGK 1
引火点(°F)
does not flash
引火点(℃)
does not flash
Antimicrobial agents and chemotherapy, 51(2), 483-487 (2006-12-06)
During a study of florfenicol-resistant porcine staphylococci from Denmark, the genes cfr and fexA were detected in the chromosomal DNA or on plasmids of Staphylococcus hyicus, Staphylococcus warneri, and Staphylococcus simulans. A novel variant of the phenicol resistance transposon Tn558
Journal of clinical microbiology, 39(5), 1889-1894 (2001-04-28)
We developed a rapid pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) protocol for subtyping Campylobacter isolates based on the standardized protocols used by PulseNet laboratories for the subtyping of other food-borne bacterial pathogens. Various combinations of buffers, reagents, reaction conditions (e.g., cell suspension
資料
The term “Restriction enzyme” originated from the studies of Enterobacteria phage λ (lambda phage) in the laboratories of Werner Arber and Matthew Meselson.
ライフサイエンス、有機合成、材料科学、クロマトグラフィー、分析など、あらゆる分野の研究に経験のあるメンバーがおります。.
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