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ヒトCOT DNA

from human placenta DNA, enriched for repetitive sequences

• 別名: ヒトCOT DNA, ヒトDNA
• UNSPSCコード: 41106310

特性

• 由来生物: human placenta (DNA)
• 品質水準: 100
• グレード: Molecular Biology
• 形状: solution
• 包装: pkg of 500 μg
• メーカー／製品名: Roche
• 濃度: 1 mg/mL
• 不純物: HCV/HBV, none detected; HIV 1/2, none detected
• 色: colorless
• 溶解性: water: miscible
• 保管温度: −20°C

詳細

詳細

ヒトゲノムDNAのCOT画分の大半は迅速にアニーリングする反復配列です。こうしたSINE（短鎖散在反復配列、例：Alu配列）やLINE（長鎖散在反復配列、例：L1配列）などの散在反復配列（IRS）はゲノム全体に分布しています。ヒトCOT DNAはヒト胎盤DNAから、これらの反復配列豊富な条件下でせん断、変性、再アニーリングを行うことにより得られます。

プローブ（コスミド、YAC、染色体ペインティングプローブなど）に含まれる反復配列（IRS）は、染色体やゲノム全体に分布する非特異的ハイブリダイゼーションシグナルの原因となります。これらのプローブで染色体の標的部位（単一コピー配列、低コピー数反復など）に特異的なハイブリダイゼーションを行うため、過剰な非標識ヒトCOT DNA存在下でプローブを変性する必要があります。このDNAは競合のために用いられます。その後のプレアニーリング段階において、プローブの反復配列は迅速にヒトCOT DNAの過剰反復配列とハイブリダイズしますが、プローブの特異的配列のほとんどは一本鎖のまま残り、染色体の標的にハイブリダイズすることができます。この技術は染色体の正常部位抑制（CISS）ハイブリダイゼーションとして知られています。

アプリケーション

ヒトCOT DNAは染色体の正常部位抑制（CISS）ハイブリダイゼーションに使用されます。コスミド又はYACプローブには反復配列が含まれているため、単一特異性のハイブリダイゼーションシグナルが染色体全体に分布してしまいます。染色体の標的部位に特異的なハイブリダイゼーションを行うため、プローブの変性時に過剰な非標識ヒトCOT DNAを競合のために加えます。ヒトCOT DNAは、マイクロアレイにおいてヒトの反復配列に対する非特異的なハイブリダイゼーションの抑制に、また濾過や蛍光in situハイブリダイゼーションにおいて使用することができます。

シーケンス

アガロースゲル電気泳動において、ヒトCOT DNAフラグメントの長さは最大で50～300ヌクレオチドの範囲に分布します。

物理的形状

溶液、1 mg/mL、10 mM Tris-HCl、1 mM EDTA、pH 7.4

その他情報

ライフサイエンス研究専用。診断目的での使用はできません。

安全性情報

• 保管分類コード: 12 - Non Combustible Liquids
• WGK: nwg
• 引火点(°F): No data available
• 引火点(℃): No data available