Descrizione generale
La perossidasi di rafano si isola dalle radici del rafano (Amoracia rusticana) e appartiene al gruppo delle perossidasi con ferroprotoporfirina. L′HRP è un polipeptide a singola catena che contiene quattro ponti disolfuro. È una glicoproteina che contiene il 18% di carboidrati. La composizione dei carboidrati include galattosio, arabinosio, xilosio, fucosio, mannosio, mannosamina e galattosamina, a seconda del singolo isozima. Il peso molecolare (circa 44 kDa) include la catena polipeptidica (33.890 Dalton), la emina con Ca2+ (circa 700 Dalton) e il carboidrato (circa 9.400 Dalton). Esistono almeno sette isoenzimi di HRP. Il punto isoelettrico degli isoenzimi della perossidasi di rafano è compreso fra 3,0 e 9,0.
Applicazioni
La perossidasi di rafano (HRP) viene isolata dalle radici del rafano (Amoracia rusticana). Trova impiego in applicazioni biochimiche come western blot, ELISA e immunoistochimica. La perossidasi di rafano è usata per amplificare un segnale debole e aumentare la rivelabilità di una molecola bersaglio, ad esempio una proteina. Il prodotto P6782, di tipo VI-A, è una polvere liofilizzata, essenzialmente priva di sali. È usata per quantificare il colesterolo e i suoi esteri e per studiare in vitro la deposizione di lipidi su lenti a contatto in idrogel e silicone idrogel.
L′enzima di Sigma è stato usato nello sviluppo di un biosensore della galattosio ossidasi-perossidasi rapido e sensibile per il rilevamento del galattosio con stabilità prolungata. È stato usato come componente di una piastra di terreno (MRS agar) contenente 3,3′,5,5′-tetrametilbenzidina (TMB) per la crescita di Lactobacillus sp. La TMB agisce come substrato cromogenico della perossidasi. La perossidasi genera O2 dall′H2O2 prodotta dai lattobacilli e la TMB colora le colonie in azzurro in presenza di O2. Così dopo 48 ore di incubazione con 5% di CO2 in aria, le colonie che producono H2O2 su MRS agar appaiono blu. I non produttori di H2O2 sono incolori. È stata usata per studiare l′effetto stabilizzante dell′alcol polivinilico sulla perossidasi di rafano. È stata usata anche per la determinazione del glucosio e dei perossidi in soluzione.
Azioni biochim/fisiol
Incubata con un substrato, la perossidasi di rafano produce un derivato colorato, fluorimetrico o luminescente della molecola marcata, consentendone la quantificazione. La perossidasi di rafano ha dimostrato di ridurre leggermente il livello di inibizione in un mutante cydAB.
L′HRP si combina rapidamente con il perossido di idrogeno (H2O2) e il complesso che ne risulta [HRP-H2O2] può ossidare diversi donatori di idrogeno. Il pH ottimale è 6,0-6,5 e la stabilità dell′enzima è massima nell′intervallo di pH di 5,0-9,0. L′HRP può essere coniugata agli anticorpi con diversi metodi che includono l′uso di glutaraldeide, ossidazione con periodato, ponti disolfuro e anche per mezzo di agenti reticolanti guidati da ammine e tioli. È più piccola e più stabile rispetto ai marcatori enzimatici, β-galattosidasi e fosfatasi alcalina Di conseguenza è il marcatore preferito. Inoltre la sua glicosilazione comporta un minor numero di legami non specifici. È stato osservato che sodio azide, cianuro, L-cistina, dicromato, etilenetiourea, idrossilamina, solfuro, vanadato, acido p-aminobenzoico, oltre agli ioni Cd2+, Co2+, Cu2+, Fe3+, Mn2+, Ni2+ e Pb2+ inibiscono l′attività dell′enzima.
Confezionamento
Confezionata in mg solidi
Definizione di unità
Una unità ABTS ossiderà 1 μmole di ABTS al minuto a 25 °C, a pH 5,0.
Una unità di pirogallolo forma 1,0 mg di purpurogallina da pirogallolo in 20 secondi a pH 6,0 e 20 °C.
Nota sulla preparazione
Le soluzioni di questo prodotto alla concentrazione di 1 mg/mL in tampone fosfato 0,1 M (pH 6,0) rimangono attive per almeno due settimane a temperatura ambiente. La soluzione conserva l′attività dopo 5 cicli di congelamento e scongelamento.
Risultati analitici
Il RZ (Reinheitszahl) è il rapporto di assorbanza A403/A275 determinato a 0,5-1,0 mg/mL in acqua deionizzata. Misura il contenuto di emina, non l′attività enzimatica. Anche preparazioni con un RZ elevato possono avere una bassa attività enzimatica.
Questo prodotto viene saggiato con ABTS per confrontarlo con facilità con l′unità di altri fornitori: circa 1000 unità per mg solido