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G211000

Sigma-Aldrich

DMT-2′O-TBDMS-rG(ib) Phosphoramidite

Sinônimo(s):

N-(2-methyl-1-oxopropyl)-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-guanosine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite]

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About This Item

Fórmula empírica (Notação de Hill):
C50H68N7O9PSi
Número CAS:
Peso molecular:
970.18
Número MDL:
Código UNSPSC:
12352200
ID de substância PubChem:
NACRES:
NA.51

fonte biológica

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Nível de qualidade

linha de produto

Proligo Reagents

Ensaio

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

forma

powder

técnica(s)

oligo synthesis: suitable

Impurezas

≤0.3 wt. % water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR)
≤0.5% single Impurity (reversed phase HPLC)
≤3 wt. % residual Solvent content

cor

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

adequação

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

perfil de nucleosídeo

base: guanosine
base protecting group: isobutyryl
2' protecting group: TBDMS
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

temperatura de armazenamento

−20°C

cadeia de caracteres SMILES

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O[Si](C)(C)C(C)(C)C)[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4C(=O)NC(NC(=O)C(C)C)=Nc34)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C50H68N7O9PSi/c1-32(2)45(58)54-48-53-44-41(46(59)55-48)52-31-56(44)47-43(66-68(12,13)49(7,8)9)42(65-67(63-29-17-28-51)57(33(3)4)34(5)6)40(64-47)30-62-50(35-18-15-14-16-19-35,36-20-24-38(60-10)25-21-36)37-22-26-39(61-11)27-23-37/h14-16,18-27,31-34,40,42-43,47H,17,29-30H2,1-13H3,(H2,53,54,55,58,59)/t40-,42-,43-,47-,67?/m1/s1

chave InChI

PGJKESPHANLWME-FTZVBZPOSA-N

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Descrição geral

DMT-2′O-TBDMS-rG(ib) Phosphoramidite belongs to the group of 2′O-TBDMS RNA Phosphoramidites.

Aplicação

RNA interference (RNAi) has become a popular tool for the sequence-specific inhibition of gene expression and can be used in target validation and other drug development techniques. The most convenient method to provide sequence-specific RNA oligonucleotides is a chemical synthesis on a solid support with RNA phosphoramidites and RNA CPG, analogous to DNA synthesis.

Características e benefícios

  • Industry standard 2′O-TBDMS protective group
  • Consistent lot-to-lot purity and performance
  • Compatible with deprotection methods based on methylamine or AMA
  • Standard RNA phosphoramidites provide excellent coupling results when used with ETT or BTT as an activator; best results are obtained with Activator 42
  • Capping with standard acetic anhydride capping reagent rather than with Fast Deprotection Cap A
  • Manufactured under a certified ISO 9001 quality system

Outras notas

The unique properties of RNA have stimulated the development of a variety of applications in diagnostics and therapeutics, as well as in basic molecular biology research where RNA can be used as:
  • Catalytic agents (ribozymes)
  • Affinity ligands (aptamers)
  • Agents to induce gene silencing (RNA interference)

Código de classe de armazenamento

11 - Combustible Solids

Classe de risco de água (WGK)

WGK 2

Ponto de fulgor (°F)

Not applicable

Ponto de fulgor (°C)

Not applicable


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