CL11430

DMT-locMeC(bz) Phosphoramidite

configured for ABI

• Wzór empiryczny (zapis Hilla): C₄₈H₅₄N₅O₉P
• Numer CAS: 206055-82-5
• Masa cząsteczkowa: 875.94
• Numer MDL: MFCD00098991
• Kod UNSPSC: 41116105
• NACRES: NA.51

Właściwości

• pochodzenie biologiczne: non-animal source (BSE/TSE no Risk)
• Poziom jakości: 300
• linia produktu: Proligo Reagents
• Próba: ≥98.0% (³¹P-NMR); ≥98.0% (reversed phase HPLC)
• Formularz: powder
• zanieczyszczenia: ≤3 wt. % Residual Solvent Content; <0.4% Water Content (Karl Fischer); <0.5% Single unspecified Impurity (reversed phase HPLC)
• kolor: white to off-white
• rozpuszczalność: acetonitrile: 0.2 M, clear, colorless
• Absorpcja: <0.1 in acetonitrile at 0.2 M
• przydatność: conforms to structure for H-NMR; conforms to structure for LC-MS
• kompatybilność: configured for ABI
• temp. przechowywania: −20°C

Opis

Opis ogólny

Fosforoamidyt DMT-locMeC(bz) należy do grupy fosforoamidytów LNA. Znany jest jako DMT-5-Me-locCytidine(N4-Benzoyl)- ß-Cyanoethylphosphoramidite. Cykl syntezy oligonukleotydów z zablokowanym kwasem nukleinowym (LNA) składa się z tej samej serii reakcji, co cykl stosowany dla monomerów DNA. Jednak szybkość sprzęgania dla monomerów 3555 jest wolniejsza w porównaniu do monomerów DNA (czas sprzęgania 8 minut jest zalecany dla monomerów LNA w porównaniu do 90 sekund dla monomerów DNA). Z wyjątkiem monomerów LNA, synteza LNA jest przeprowadzana przy użyciu tych samych odczynników, co synteza DNA.

Cechy i korzyści

Kluczowe cechy fosforoamidytów LNA:

• Oligonukleotydy LNA są przygotowywane za pomocą chemii fosforoamidytów
• Można stosować standardowe platformy syntezatorów DNA. Nie jest wymagana zmiana odczynników powszechnie stosowanych do syntezy DNA.
• Aby jeszcze bardziej poprawić charakterystykę hybrydyzacji LNA, zamiast cytydyny stosuje się 5-metylocytydynę.
• Monomery LNA są tak samo rozpuszczalne w acetonitrylu jak ich odpowiedniki DNA (z wyjątkiem pochodnej 5-metylo-cytydyny, która wymaga zastosowania 10-20% dichlorometanu jako współrozpuszczalnika)
• Mieszane oligonukleotydy zawierające monomery LNA, DNA i/lub RNA mogą być łatwo łączone.
• Można zaprojektować i przygotować oligonukleotydy LNA o predefiniowanych temperaturach topnienia (Tm).

Inne uwagi

3555 fosforoamidytów firmy Merck rozcieńcza się suchym acetonitrylem, z wyjątkiem locMeC(bz)-fosforoamidytu. Ten fosforoamidyt wymaga zastosowania kosolwentu, aby zapobiec krystalizacji z roztworu na syntezatorze. Dichlorometan lub tetrahydrofuran (THF) mogą być stosowane jako współrozpuszczalniki z acetonitrylem w celu całkowitego rozpuszczenia locMeC(bz)-fosforoamidytu.

Informacje prawne

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Kod klasy składowania: 11 - Combustible Solids
• Klasa zagrożenia wodnego (WGK): WGK 3
• Temperatura zapłonu (°F): Not applicable
• Temperatura zapłonu (°C): Not applicable