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Merck

17-614

Sigma-Aldrich

ChIPAb+トリメチルヒストンH3(Lys4)-ChIPバリデーション抗体およびプライマーセット、ウサギモノクローナル

from rabbit

別名:

Chip Rabbit Antibody and primer set, H3K4me3 ChIP, H3K4me3, Histone H3 (tri methyl K4), Histone H3K4me3, Histone H3K4me3 ChIP

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About This Item

UNSPSCコード:
12352203
eCl@ss:
32160702
NACRES:
NA.32

由来生物

rabbit

品質水準

クローン

monoclonal

化学種の反応性

mouse, human

化学種の反応性(ホモロジーによる予測)

mammals

メーカー/製品名

ChIPAb+
Upstate®

テクニック

ChIP: suitable (ChIP-seq)
western blot: suitable

アイソタイプ

IgG

NCBIアクセッション番号

UniProtアクセッション番号

輸送温度

dry ice

遺伝子情報

human ... H3F3B(3021)

詳細

すべてのChIPAb+抗体は、すべてのロットについて毎回個別にクロマチン沈降がバリデーションされます。 各ChIPAb+抗体セットには、遺伝子座に固有のコンテキストでIP結果を生物学的にバリデーションするためのコントロールプライマー(qPCRですべてのロットがテスト済み)が含まれています。qPCRプロトコルとプライマー配列が提供されるため、研究者は各自のクロマチンコンテキストでメルクの抗体を使用する際に、ChIPプロトコルをバリデーションできます。各セットには、ChIP反応の特異性を確保するためのネガティブコントロール抗体も含まれています。
ChIPAb+トリメチルヒストンH3(Lys4)セットには、抗トリメチルヒストンH3(Lys4)抗体、ネガティブコントロール抗体(正常ウサギ血清)、およびヒトGAPDH遺伝子のプロモーター内で166塩基対領域を増幅するqPCRプライマーが含まれています。 トリメチルヒストンH3(Lys4)とネガティブコントロール抗体は拡張性のある「ChIPごと」の反応サイズで供給され、トリメチルヒストンH3(Lys4)関連クロマチンの沈降を機能的にバリデーションするために使用できます。
ヒストンのメチル化は、アルギニンまたはリジンという2つの異なる残基で生じる可能性があります。ヒストンのメチル化は、メチル化した残基に応じて転写活性化または転写抑制が関与する場合があります。ヒストンH3のリジン4は、SET1やASH1などの異なるヒストンメチルトランスフェラーゼ(HMT)によって、モノ-、ジ-またはトリメチル化する可能性があります。Lys4のメチル化は、しばしば転写活性化が関与して生じます。デメチラーゼLSD1は、ヒストンH3 Lys4を脱メチル化することができます。

特異性

トリメチルヒストンH3(Lys4)

免疫原

エピトープ:トリメチルLys4
トリメチルヒストンH3(Lys4)抗体は、ヒトヒストンH3のトリメチル-リジン4に相当するme3Kが含まれる配列…RT[me3K]QT…を含む、BSA結合、合成ペプチドに対して作成されています。

アプリケーション

クロマチン免疫沈降:
未処理またはUV処理済み(50ジュール/m2で6時間)のU2OS細胞(IPあたり3 X 106細胞相当)から調製された超音波分解クロマチンを、3 μLのウサギ抗トリメチルヒストンH3(Lys4)およびMagna ChIP A(カタログ番号17-610)キットを使用してクロマチン免疫沈降しました。Sp1結合部位を持つヒトp21プロモーターに隣接するChIPプライマーp21を用いたqPCRで、トリメチルヒストンH3(Lys4)関連DNA断片の免疫沈降が検証されています(図を参照)。
Fold Increaseは、各クロマチンサンプルのインプットによって得られる標準曲線から抽出された正規化平均IP量の割合です。このプロモーターが関与するトリメチルヒストン(Lys4)免疫沈降活性は、他の研究によって示されている通りUV処理によって増加します。
実験の詳細については、EZ-Magna A ChIP(カタログ番号17-408)またはEZ-ChIP(カタログ番号17-371)プロトコルをご覧ください。

ChIP-seq分析:
クロマチン免疫沈降は、Magna ChIP HiSensキット(17-10460)、3 µL抗トリメチルヒストンH3(Lys4)抗体(カタログ番号17-614)または20 µLプロテインA/Gビーズ、および1e6架橋結合HeLa細胞クロマチンを使用し、さらに磁気ビーズを用いてDNA精製することにより実施されています。Illuminaバーコード付きアダプターを用いた標準プロトコルによってInputおよびChIP DNAサンプルからライブラリを準備し、Illumina HiSeq装置で分析を行いました。FastQファイルから得られた1800万に及ぶ膨大な数の読取り値を、Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)およびTagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/)タグ除去の順に使用してマッピングしました。MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)を用いてピークを特定し、UCSCゲノムブラウザ(http://genome.ucsc.edu)のカスタムトラックとしてBigWigおよびBEDファイルからピークと読取り値を可視化しました。17~614および07~473データセットで特定されたピークの上位25%が、HeLa S3のENCODE H3K4me3 BROADヒストントラックで特定されたピークと99%の重複を示しました。

ウェスタンブロッティングおよびペプチド阻害:
代表的なブロットです。HeLa酸抽出物を電気泳動によって分解し、ニトロセルロースに転送し、さらに抗トリメチルヒストンH3(Lys4)(1:2,000、レーン1)により精査するか、またはモノメチル-リジン4(レーン2)、ジメチルリジン4(レーン3)、トリメチル-リジン4(レーン4)で修飾した0.4 μMヒストンH3ペプチドで前培養しました。
HRPと結合したヤギ抗ウサギ二次抗体と化学発光検出
システムを使用して、タンパク質を可視化しました(図を参照)。
ChIP-グレード抗体と、H3K4Me3のクロマチン免疫沈降専用のコントロールPCRプライマーを含む、トリメチルヒストンH3(Lys4)ChIPバリデーション済みの抗体とプライマーのセット。
研究カテゴリー
エピジェネティックスおよび核機能
研究サブカテゴリー
クロマチン生物学

包装

1キットあたり25アッセイ、クロマチン免疫沈降1回あたり約3 μL

構成

抗トリメチルヒストンH3(Lys4)(精製ウサギIgG)、1バイアル

ネガティブChIPコントロールウサギIgG、1バイアル

ChIPプライマーGAPDH、1バイアル

品質

クロマチン免疫沈降:
未処理HeLa細胞(1 X 106細胞相当)から調製された超音波分解クロマチンを、3 μLの正常ウサギIgGまたは3 μLの抗トリメチルヒストンH3(Lys4)モノクローナルIgGのいずれか、およびMagna ChIP A(部品番号17-610)キットを使用してクロマチン免疫沈降しました。
トリメチルヒストンH3(Lys4)関連DNA断片が正常に免疫沈降することを、ヒトGAPDHプロモーターに隣接するコントロールChIPプライマーを用いたqPCRによって検証しました(図を参照)。実験の詳細については、EZ-Magna A ChIPプロトコルを参照してください。

ターゲットの説明

17 kDa

物理的形状

フォーマット:精製
抗トリメチルヒストンH3(Lys4)リコンビナントウサギモノクローナルIgG抗体。保存用緩衝液(0.1Mトリス-グリシン(pH 7.4)、0.15 M塩化ナトリウム、0.05%NaN3に40%グリセロールを添加)中に75 μLのプロテインA精製ウサギIgGを含む1バイアル。

正常ウサギIgG。75 μLの正常ウサギIgGを含む1バイアル。

コントロールプライマー。ヒトGAPDHに特異的な5 μMの各プライマーを75 μL含む1バイアル。
FOR:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV:TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA

保管および安定性

-20°Cで受領日から1年間安定です。

アナリシスノート

コントロール
ネガティブコントロール抗体精製ウサギIgGおよびヒトGAPDHプロモーターに特異的なコントロールプライマーを含む。

法的情報

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

免責事項

メルクのカタログまたは製品に添付されたメルクのその他の文書に記載されていない場合、メルクの製品は研究用途のみを目的としているため、他のいかなる目的にも使用することはできません。このような目的としては、未承認の商業用途、in vitroの診断用途、ex vivoあるいはin vivoの治療用途、またはヒトあるいは動物へのあらゆる種類の消費あるいは適用などがありますが、これらに限定されません。

保管分類コード

10 - Combustible liquids


適用法令

試験研究用途を考慮した関連法令を主に挙げております。化学物質以外については、一部の情報のみ提供しています。 製品を安全かつ合法的に使用することは、使用者の義務です。最新情報により修正される場合があります。WEBの反映には時間を要することがあるため、適宜SDSをご参照ください。

Jan Code

17-614:


試験成績書(COA)

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Xuhong Yu et al.
Plant physiology, 153(3), 1074-1084 (2010-05-14)
FLOWERING LOCUS C (FLC) is a key repressor of flowering in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) and is regulated, both positively and negatively, by posttranslational histone modifications. For example, vernalization (the promotion of flowering by cold temperatures) epigenetically silences FLC expression through
Mammary-specific gene activation is defined by progressive recruitment of STAT5 during pregnancy and the establishment of H3K4me3 marks.
Kang, K; Yamaji, D; Yoo, KH; Robinson, GW; Hennighausen, L
Molecular and cellular biology null
Epigenetic histone modification of Epstein-Barr virus BZLF1 promoter during latency and reactivation in Raji cells.
Murata, T; Kondo, Y; Sugimoto, A; Kawashima, D; Saito, S; Isomura, H; Kanda, T; Tsurumi, T
Journal of virology null
Regulation of cyclin B2 expression and cell cycle G2/m transition by menin.
Wu T, Zhang X, Huang X, Yang Y, Hua X
The Journal of Biological Chemistry null
Temporal dynamics and developmental memory of 3D chromatin architecture at Hox gene loci.
Noordermeer, D; Leleu, M; Schorderet, P; Joye, E; Chabaud, F; Duboule, D
eLife null

ライフサイエンス、有機合成、材料科学、クロマトグラフィー、分析など、あらゆる分野の研究に経験のあるメンバーがおります。.

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