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一般說明
对每批、每次的全部ChIPAb+抗体的染色质沉淀进行单独验证。每个ChIPAb+抗体组均包含对照引物(通过qPCR对每个批次进行检测),以在基因座特异性环境下对IP结果进行生物学验证。提供了qPCR方案和引物序列,使研究人员能够在染色质环境中使用我们的抗体时验证ChIP方案。每组还包括阴性对照抗体,以确保ChIP反应的特异性。
ChIPAb+二甲基组蛋白H3(Lys4)组包括抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体,阴性对照抗体(纯化的小鼠IgG)和qPCR引物,可扩增人GAPDH基因编码区内的213 bp区域。二甲基组蛋白H3(Lys4)和阴性对照抗体以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证二甲基组蛋白H3(Lys4)相关染色质的沉淀。
ChIPAb+二甲基组蛋白H3(Lys4)组包括抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体,阴性对照抗体(纯化的小鼠IgG)和qPCR引物,可扩增人GAPDH基因编码区内的213 bp区域。二甲基组蛋白H3(Lys4)和阴性对照抗体以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证二甲基组蛋白H3(Lys4)相关染色质的沉淀。
特異性
识别赖氨酸4二甲基化的组蛋白H3,Mr 17 kDa。
该肽序列在广泛的动植物物种中是相同的,因此预期有广泛的交叉反应性。。
免疫原
表位:氨基酸1-12
针对对应于组蛋白H3的氨基酸1-12的合成肽(Lys4二甲基化)制备二甲基组蛋白H3(Lys4)纯化抗体。
應用
染色质免疫沉淀:
使用2 µg正常小鼠IgG或抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体和Magna ChIP G试剂盒(目录号17-611),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 2 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用β-珠蛋白ChIP引物与GAPDH编码引物通过qPCR验证了二甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。 数据表示为每个IP样品相对于带有指定引物的每种抗体的输入染色质的输入百分比。
请参阅EZ-Magna G ChIP(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号17-371)协议以获取实验详细信息。
ChIP-seq分析:
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(目录号17-10460),2 µg抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体(目录号17-677),20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过1600万次读取。使用MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从BigWig和BED文件在UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。在04-790和17-677数据集中识别出的最高25%峰与HeLa S3的ENCODE H3K4me2 BROAD组蛋白轨迹中识别出的峰有92和90%重叠。
蛋白质印迹分析:
重组组蛋白H3(泳道1)和HeLa酸提取物(泳道2)通过电泳分离,转移到PVDF膜上,并用抗二甲基组蛋白H3(Lys4)(2 μg/mL)进行探测。
使用与HRP偶联的山羊抗小鼠二抗(目录号AP124P)和化学发光检测系统对蛋白质进行可视化。
斑点印迹分析:
用抗二甲基H3(Lys4)(浓度为2.0 ug/mL,稀释度为1:500)探测含有具有各种修饰的组蛋白肽的AbSurance组蛋白H3抗体特异性阵列(目录号16-667)和AbSurance组蛋白H2A,H2B,H4抗体特异性阵列(目录号16-665)。 使用与HRP偶联的驴抗小鼠IgG和化学发光检测系统观察蛋白质。
Beadlyte组蛋白肽特异性测定:
将0.15 μg/ml纯化的抗二甲基组蛋白H3(Lys4),
克隆CMA303与微球混合物一起孵育与组蛋白H3肽
偶联,并进行以下修饰:
1. 未修饰的H3(K4)
2. 单甲基H3(K4)
3. 二甲基H3(K4)
4. 三甲基H3(K4)
5.三甲基H3(K27)
然后通过过滤除去未结合的抗体。
将肽抗体复合物与a
PE偶联的抗小鼠二抗一起孵育。
在Luminex 100
仪器上读取荧光。绘制了中值荧光强度(MFI)。
使用2 µg正常小鼠IgG或抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体和Magna ChIP G试剂盒(目录号17-611),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 2 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用β-珠蛋白ChIP引物与GAPDH编码引物通过qPCR验证了二甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。 数据表示为每个IP样品相对于带有指定引物的每种抗体的输入染色质的输入百分比。
请参阅EZ-Magna G ChIP(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号17-371)协议以获取实验详细信息。
ChIP-seq分析:
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(目录号17-10460),2 µg抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体(目录号17-677),20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过1600万次读取。使用MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从BigWig和BED文件在UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。在04-790和17-677数据集中识别出的最高25%峰与HeLa S3的ENCODE H3K4me2 BROAD组蛋白轨迹中识别出的峰有92和90%重叠。
蛋白质印迹分析:
重组组蛋白H3(泳道1)和HeLa酸提取物(泳道2)通过电泳分离,转移到PVDF膜上,并用抗二甲基组蛋白H3(Lys4)(2 μg/mL)进行探测。
使用与HRP偶联的山羊抗小鼠二抗(目录号AP124P)和化学发光检测系统对蛋白质进行可视化。
斑点印迹分析:
用抗二甲基H3(Lys4)(浓度为2.0 ug/mL,稀释度为1:500)探测含有具有各种修饰的组蛋白肽的AbSurance组蛋白H3抗体特异性阵列(目录号16-667)和AbSurance组蛋白H2A,H2B,H4抗体特异性阵列(目录号16-665)。 使用与HRP偶联的驴抗小鼠IgG和化学发光检测系统观察蛋白质。
Beadlyte组蛋白肽特异性测定:
将0.15 μg/ml纯化的抗二甲基组蛋白H3(Lys4),
克隆CMA303与微球混合物一起孵育与组蛋白H3肽
偶联,并进行以下修饰:
1. 未修饰的H3(K4)
2. 单甲基H3(K4)
3. 二甲基H3(K4)
4. 三甲基H3(K4)
5.三甲基H3(K27)
然后通过过滤除去未结合的抗体。
将肽抗体复合物与a
PE偶联的抗小鼠二抗一起孵育。
在Luminex 100
仪器上读取荧光。绘制了中值荧光强度(MFI)。
研究子类别
染色质生物学
染色质生物学
研究类别
表观遗传学&核功能
表观遗传学&核功能
该ChIPAb+二甲基组蛋白H3(Lys4)-ChIP验证的抗体&引物组方便地包括抗体 & 特异性对照PCR引物。
包裝
25次测定/试剂盒,约2 μg/染色质免疫沉淀
品質
染色质免疫沉淀:
使用2 µg正常小鼠IgG或抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体和Magna ChIP G试剂盒(目录号17-611),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 1 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用ChIP引物GAPDH编码通过qPCR验证了二甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。
有关实验详细信息,请参阅EZ-Magna G ChIP(目录号17-409)或EZ-ChIP(目录号17-371)方案。
使用2 µg正常小鼠IgG或抗二甲基组蛋白H3(Lys4)抗体和Magna ChIP G试剂盒(目录号17-611),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 1 X 106细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用ChIP引物GAPDH编码通过qPCR验证了二甲基组蛋白H3(Lys4)相关DNA片段的成功免疫沉淀(请参见图)。
有关实验详细信息,请参阅EZ-Magna G ChIP(目录号17-409)或EZ-ChIP(目录号17-371)方案。
標靶描述
约17 kDa的二甲基-组蛋白H3
外觀
形式:纯化
抗二甲基组蛋白H3(Lys4)(小鼠单克隆IgG1,克隆CMA303)。一个小瓶,包含50 μg蛋白G纯化抗体,溶于50 μL PBS(含0.05%叠氮化钠)中。储存于-20°C。
正常小鼠IgG。两个小瓶,包含25 μg纯化小鼠IgG,溶于25 μL储存缓冲液(含0.1%叠氮化钠)中。储存于-20°C。
ChIP引物GAPDH编码。一个小瓶,其中包含75 μL的5 μM每种对人GAPDH编码区具有特异性的引物。储存于-20°C。
对于:GGC TCC CAC CTT TCT CAT CC
REV: GGC CAT CCA CAG TCT TCT GG
正常小鼠IgG。两个小瓶,包含25 μg纯化小鼠IgG,溶于25 μL储存缓冲液(含0.1%叠氮化钠)中。储存于-20°C。
ChIP引物GAPDH编码。一个小瓶,其中包含75 μL的5 μM每种对人GAPDH编码区具有特异性的引物。储存于-20°C。
对于:GGC TCC CAC CTT TCT CAT CC
REV: GGC CAT CCA CAG TCT TCT GG
儲存和穩定性
自收到之日起,在-20°C条件下可稳定保存1年。
分装直至初始解冻,以避免冻融循环。
分装直至初始解冻,以避免冻融循环。
分析報告
对照
包括阴性对照小鼠IgG抗体和对人β-珠蛋白特异性的对照引物。
包括阴性对照小鼠IgG抗体和对人β-珠蛋白特异性的对照引物。
法律資訊
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儲存類別代碼
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