03-310

生細胞RNA構造分析用In Vivo SHAPE試薬

permits the analysis of RNA structure in living cells

• 別名: SHAPE reagent
• UNSPSCコード: 12161503
• eCl@ss: 32161000
• NACRES: NA.32

特性

• 品質水準: 100
• 形状: liquid
• メーカー／製品名: Upstate^®
• 濃度: 2 M
• テクニック: activity assay: suitable (reverse transcriptase)
• 輸送温度: dry ice

詳細

詳細

特徴および長所

• すぐに使用できるRNaseフリー溶液
• 毒性が低いため生細胞への使用が可能
• 高い細胞透過性によりRNAの迅速な修飾を実現
• すべてのRNAヌクレオチドと偏りなく反応するため、高分解能マッピングが可能

In Vivo SHAPE試薬は、RNA構造の特定に使用されます。この試薬には、高純度タイプの2-メチルニコチン酸イミダゾリド（NAI）が含まれています。この化合物は、Selective 2’-Hydroxyl Acylation and Primer Extension（SHAPE）によって検出できる2’-O-付加物を、RNAの一本鎖領域で形成します。

SHAPE法に使用される他の試薬とは異なり、NAI–ベースのIn Vivo SHAPE試薬はすぐに細胞に吸収され、また毒性の低い処方となっているため、生細胞への使用に理想的です。In Vivo SHAPE試薬は、SHAPE分析に使用される他の試薬とは異なり、4つのすべてのRNAヌクレオチドと偏りなく反応します。このように毒性が低く、吸収が迅速で、ヌクレオチドの偏りがないことから、さまざまな生物系での高分解能のRNA構造分析が可能となっています。

高次構造体へのフォールディングにより、RNAは生細胞内で機能して、エフェクタータンパク質とともに動的複合体を形成できるようになります。これらの3D構造の予測は困難なため、RNAフォールディングを研究するための数多くのプロービング技術が開発されてきました。

2-メチルニコチン酸イミダゾリド（NAI）などの化合物を含むIn Vivo SHAPE試薬は、2-O-付加物の形成をもたらします。これらの付加物は、一本鎖不対RNA上では速やかに生じ、塩基対（二本鎖）RNA上では緩やかに生じます。修飾されたRNAはその後、プライマー伸長法によって分析できます。修飾されたヌクレオチドは、RNA依存性DNAポリメラーゼによって伸長されないため、修飾部位の検出が可能になります。

構成

DMSO中の2-メチルニコチン酸イミダゾリド（NAI）

品質

NAI化合物の純度はHPLCにより試験済み。

物理的形状

DMSO中の2M NAI

DMSO溶液中の2M NAI（>97%純度）を含有する0.5 mLバイアル

保管および安定性

自動霜取り機能を備えない冷凍庫に入れ、-20°Cで遮光してNAIを保存してください。適切に（遮光し、過度な凍結・融解サイクルを避けて）保存すれば、本製品は受領日から最長6か月間安定です。

法的情報

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

免責事項

メルクのカタログまたは製品に添付されたメルクのその他の文書に記載されていない場合、メルクの製品は研究用途のみを目的としているため、他のいかなる目的にも使用することはできません。このような目的としては、未承認の商業用途、in vitroの診断用途、ex vivoあるいはin vivoの治療用途、またはヒトあるいは動物へのあらゆる種類の消費あるいは適用などがありますが、これらに限定されません。

安全性情報

• 保管分類コード: 10 - Combustible liquids
• WGK: WGK 3