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WTA1

Sigma-Aldrich

TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit

DNA polymerase separate.

Sinonimo/i:

Kit di amplificazione dell’intero trascrittoma TransPlex®

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About This Item

Codice UNSPSC:
41121800
NACRES:
NA.55

Livello qualitativo

tecniche

whole genome amplification: suitable

Condizioni di spedizione

wet ice

Temperatura di conservazione

−20°C

Descrizione generale

Il metodo TransPlex® per l′amplificazione dell′intero trascrittoma (WTA) consente l′amplificazione rappresentativa dell′RNA totale presente in quantitativi nell′ordine dei nanogrammi in meno di 4 ore e senza 3′-bias. I quantitativi di amplificato, nell′ordine dei microgrammi, ottenuti da tessuto, cellule in coltura, campioni fissati in formalina, o siero, sono sufficienti per applicazioni a valle come la qPCR e i microarray.

Applicazioni

Il kit per l′amplificazione dell′intero trascrittoma TransPlex® (Whole Transcriptome Amplification) è stato usato per sintetizzare il cDNA a doppio filamento. Inoltre è stato usato per l′amplificazione del cDNA
Idoneo all′impiego con le applicazioni successive, tra cui:
  • qPCR
  • analisi di microarray
  • clonaggio

Caratteristiche e vantaggi

  • Amplificazione dell′RNA totale in meno di 4 ore con meno di 30 minuti di manipolazione
  • Con soli 5 ng di materiale di partenza si produce una libreria altamente rappresentativa dall′RNA totale.
  • Quantità in microgrammi del prodotto dell′amplificazione generate da RNA intatto da tessuto, cellule in coltura, siero o da RNA degradato da campioni fissati in formalina inclusi in paraffina

Principio

Il processo di WTA prevede due fasi. Nella prima fase, si sottopone l′RNA campione alla trascrizione inversa con primer non autocomplementari costituiti da un′estremità 3′ quasi casuale e un′estremità 5′ universale. Con il procedere della polimerizzazione, i singoli filamenti dislocati agiscono come nuovi templati per l′annealing e l′estensione dei primer. La libreria di cDNA OmniPlex che ne risulta, costituita da frammenti casuali, sovrapponentesi, da 100-1000 basi affiancati dalla sequenza terminale universale, viene quindi amplificata dalla PCR con il primer universale per realizzare il prodotto della WTA.

Note legali

TransPlex is a registered trademark of Rubicon Genomics, Inc.

I componenti del kit sono disponibili anche separatamente

N° Catalogo
Descrizione
SDS

  • W4502Water, Nuclease-Free Water, for Molecular BiologySDS

  • D7295Deoxynucleotide Mix, 10 mM, Molecular Biology ReagentSDS

Pittogrammi

Exclamation mark

Avvertenze

Warning

Indicazioni di pericolo

Classi di pericolo

Eye Irrit. 2

Codice della classe di stoccaggio

10 - Combustible liquids

Punto d’infiammabilità (°F)

Not applicable

Punto d’infiammabilità (°C)

Not applicable


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Complete genome sequence of avian paramyxovirus type 7 (strain Tennessee) and comparison with other paramyxoviruses
Xiao S, et al.
Virus Research, 145(1), 80-91 (2009)
Sa Xiao et al.
Virus research, 145(1), 80-91 (2009-06-23)
The complete genome sequence of avian paramyxovirus serotype 7 (APMV-7) prototype strain dove/Tennessee/4/75 was determined. The genome size is 15,480 nucleotides (nt) long and follows the "rule of six". The genome contains six non-overlapping genes in the order of 3'-N-P/V/W-M-F-HN-L-5'.
Catarina Guimarães-Teixeira et al.
Journal of personalized medicine, 11(10) (2021-10-24)
(1) Background: Methylation of N6-adenosine (m6A) is the most abundant messenger RNA (mRNA) modification in eukaryotes. We assessed the expression profiles of m6A regulatory proteins in renal cell carcinoma (RCC) and their clinical relevance, namely, as potential biomarkers. (2) Methods:
Munehiro Okamoto et al.
Scientific reports, 5, 8850-8850 (2015-03-07)
We discovered a lethal hemorrhagic syndrome arising from severe thrombocytopenia in Japanese macaques kept at the Primate Research Institute, Kyoto University. Extensive investigation identified that simian retrovirus type 4 (SRV-4) was the causative agent of the disease. SRV-4 had previously
Eszter Posfai et al.
Genes & development, 26(9), 920-932 (2012-04-14)
In mammals, totipotent embryos are formed by fusion of highly differentiated gametes. Acquisition of totipotency concurs with chromatin remodeling of parental genomes, changes in the maternal transcriptome and proteome, and zygotic genome activation (ZGA). The inefficiency of reprogramming somatic nuclei

Articoli

Epigenetic modifications are thought to occur through two key interconnected processes—DNA methylation and the covalent modification of histones.

Protocolli

Amplification products generated by the TransPlex® WTA and Complete WTA2 kits are suitable for microarray target for expression analyses, and can be incorporated into existing Illumina workflows.

Il team dei nostri ricercatori vanta grande esperienza in tutte le aree della ricerca quali Life Science, scienza dei materiali, sintesi chimica, cromatografia, discipline analitiche, ecc..

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