MABE1073

Anticorpo anti-acetyl SMC3 (Lys105/106), clone 21A7

clone 21A7, from mouse

• Sinonimo/i: Structural maintenance of chromosomes protein 3, Lys105/106 acetylated, Bamacan, Lys105/106 acetylated, Basement membrane-associated chondroitin proteoglycan, Lys105/106 acetylated, Chondroitin sulfate proteoglycan 6, Lys105/106 acetylated, Chromosome-as
• Codice UNSPSC: 12352203
• eCl@ss: 32160702
• NACRES: NA.41

Proprietà

• Origine biologica: mouse
• Livello qualitativo: 100
• Forma dell’anticorpo: purified immunoglobulin
• Tipo di anticorpo: primary antibodies
• Clone: 21A7, monoclonal
• Reattività contro le specie: human
• Reattività contro le specie (prevista in base all’omologia): nonhuman primates (based on 100% sequence homology), Xenopus (based on 100% sequence homology), bovine (based on 100% sequence homology), mouse (based on 100% sequence homology), rat (based on 100% sequence homology)
• tecniche: ChIP: suitable (ChIP-seq); ELISA: suitable; western blot: suitable
• Isotipo: IgG2bκ
• N° accesso NCBI: NP_005436
• N° accesso UniProt: Q9UQE7
• Condizioni di spedizione: ambient
• modifica post-traduzionali bersaglio: acetylation (Lys105/Lys106)
• Informazioni sul gene: human ... SMC3(9126)

Descrizione

Descrizione generale

La proteina SMC3 (Structural Maintenance of Chromosomes Protein 3, UniProt Q9UQE7; nota anche come Bamacan, proteoglicano di condroitina associato alla membrana basale, proteoglicano di condroitin-6-solfato, polipeptide associato al cromosoma, hCAP, proteina SMC 3, SMC-3) è codificata nell′uomo dal gene SMC3 (noto anche come BAM, BMH, CDLS3, CSPG6, SMC3L1) (Gene ID 9126). La coesina è complesso nucleare tripartito composto da Rad21 e dalle due proteine SMC1 e SMC3 che hanno un ruolo di mantenimento della struttura dei cromosomi. La coesina svolge un importante ruolo nel mantenere uniti i due cromatidi fratelli, è inoltre coinvolta nella riparazione del DNA e nella regolazione dell'espressione genica. Per consentire la coesione dei cromatidi fratelli durante la fase S, la proteina SMC3 viene acetilata (nell′uomo a livello di K105 e K106) da due coesin-acetiltransferasi (CoAT), ESCO1 ed ESCO2, che differiscono nel dominio N-terminale oltre che per i livelli di espressione durante lo sviluppo e durante le diverse fasi del ciclo cellulare. L'analisi ChIP-seq rivela che ESCO1 è reclutata dalla coesina a livello di oltre 11.000 siti cromatinici occupati da coesine e CTCF che mediano le interazioni a lungo raggio della cromatina e che sono coinvolte nella regolazione della trascrizione. ESCO2 invece è scarsamente arricchito nei siti target di REST/NRSF (RE1-silencing transcription factor/neuron-restrictive silencer factor), un repressore che reprime la trascrizione di geni specificamente espressi nelle cellule neuronali. Si ritiene che l'acetilazione di SMC3 induca cambiamenti conformazionali della struttura della cerniera dimerica durante la fase S e permetta l'apertura del dimero al DNA.

Specificità

Il Clone 21A7 ha legato il peptide SMC3 diacetilato in Lys105/106 con un'affinità 2 volte superiore rispetto a quella per il peptide SMC3 monoacetilato in Lys105 (Kd = 0,04 e 0,09 µg/mL, rispettivamente), mentre ha mostrato un'affinità molto ridotta verso la forma monoacetilata in Lys105 (Kd = 0,73 µg /mL) e scarsa affinità verso il peptide non acetilato (Kd = 2,99 µg/mL) (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Immunogeno

Peptide lineare coniugato con KLH, corrispondente alla sequenza della regione di SMC3 di uomo/topo/ratto che contiene lisina 105 e lisina 106 acetilate.

Applicazioni

Analisi ELISA: un lotto rappresentativo ha legato il peptide SMC3 diacetilato a livello delle lisine 105/106 con un'affinità 2 volte superiore rispetto a quella per il peptide SMC3 monoacetilato in lisina 105 (Kd = 0,04 e 0,09 µg/mL, rispettivamente), mentre ha mostrato un'affinità molto ridotta verso il peptide monoacetilato in lisina 105 (Kd = 0,73 µg/mL) e scarsa affinità verso il peptide non acetilato (Kd = 2,99 µg/mL) (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Analisi di immunoprecipitazione della cromatina (ChIP): un lotto rappresentativo ha rilevato una maggiore associazione di SMC3 a livello dei siti target della cromatina in cellule HCT-116 HDAC8-null rispetto a cellule HCT-116 wild type (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275)).

Analisi di ChIP-seq: un lotto rappresentativo ha rilevato, mediante ChIP-seq, siti di arricchimento per SMC3 a livello del cromosoma 11, inclusi l'81% dei siti target di Rad21 e il 70% dei siti target di Esco1, (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Saggio di Western blotting: un lotto rappresentativo ha rilevato l′acetilazione di SMC3 a livello delle lisine 105/106 in cellule HeLa. Il silenziamento di ESCO1 o di ESCO2 mediante trattamento con shRNA ha ridotto il livello di acetilazione di SMC3 a livello delle lisine 105/106 e una ulteriore riduzione dell′acetilazione è stata osservata silenziando simultaneamente ESCO1/2 (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Categoria di ricerca
Epigenetica & funzione nucleare

L′anti-acetil SMC3 (Lisina105/106), clone 21A7, Cat. No. MABE1073, è un anticorpo monoclonale di topo altamente specifico in grado di riconoscere la forma acetilata di SMC3 a livello delle lisine 105 e 106. E′ stato testato nelle seguenti applicazioni: immunoprecipitazione della cromatina (ChIP), ChIP-seq, ELISA e Western blotting.

Qualità

Valutato mediante Western blotting in cellule di epitelio pigmentato retinico umano (REP).

Analisi di Western blotting: una diluizione 1:1.000 di questo anticorpo ha rivelato una ridotta acetilazione di SMC3 a livello delle lisine 105/106 in 10 µg di lisato ottenuto cellule REP con Knockout della N-acetiltransferasi ESCO1 rispetto al quanto osservato in lisato ottenuto da cellule REP wild-type.

Descrizione del bersaglio

Visualizzato a ~160 kDa. 142,0/141,5/141,6/138,4/140,7 kDa (bovino/uomo/topo/ratto/xenopus) calcolati. In alcuni lisati possono essere osservate bande non caratterizzate.

Stato fisico

Formato: purificata

IgG2b di topo purificata in tampone contenente tris-glicina 0,1 M (pH 7,4), NaCl 150 mM con lo 0,05% di azoturo di sodio.

Purificato con proteina G.

Stoccaggio e stabilità

Stabile per 1 anno a 2-8 °C dalla data di ricevimento.

Altre note

Concentrazione: fare riferimento alla scheda tecnica specifica del lotto.

Esclusione di responsabilità

Salvo diversa indicazione nel nostro catalogo o in altra documentazione fornita dall′azienda insieme al prodotto, i nostri prodotti sono destinati esclusivamente a scopi di ricerca e non devono essere utilizzati per altre finalità, inclusi a titolo esemplificativo ma non esaustivo, fini commerciali non autorizzati, applicazioni diagnostiche in vitro, usi terapeutici ex vivo o in vivo o qualsiasi altro tipo di assunzione o applicazione rivolta agli esseri umani o agli animali.

Informazioni sulla sicurezza

• Codice della classe di stoccaggio: 12 - Non Combustible Liquids
• Classe di pericolosità dell'acqua (WGK): WGK 1
• Punto d’infiammabilità (°F): Not applicable
• Punto d’infiammabilità (°C): Not applicable