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Merck

WGA4

Sigma-Aldrich

GenomePlex® Kit zur Gesamtgenom-Amplifikation von Einzelzellen

Amplify genome of a single cell

Synonym(e):

Single cell whole genome amplification, Whole genome amplification

Anmeldenzur Ansicht organisationsspezifischer und vertraglich vereinbarter Preise


About This Item

EG-Nummer:
UNSPSC-Code:
12352200
NACRES:
NA.55

Qualitätsniveau

Methode(n)

whole genome amplification: suitable

Versandbedingung

wet ice

Lagertemp.

−20°C

Allgemeine Beschreibung

Das GenomePlex®-Kit zur Gesamtgenom-Amplifikation von Einzelzellen nutzt eine proprietäre Technologie, die auf der Zufallsfragmentierung von genomischer DNA und der Umwandlung der daraus resultierenden kleinen Fragmente zu PCR-amplifizierbaren Bibliotheksmolekülen basiert, die von universellen Primerbindestellen umgeben sind. Die GGA wird durch PCR-Amplifikation der Bibliotheksmoleküle mit universellen Oligonukleotidprimern erreicht. Dieses Kit wurde für die Amplifikation des Genoms einer Einzelzelle entwickelt. Dieses schnelle und unkomplizierte Verfahren bietet eine millionenfache Amplifikation, die aus einer Einzelzelle genomische DNA in Mikrogramm-Mengen erzeugt. Traditionelle Verfahren für die Einzelzell-Gesamtgenom-Amplifikation erzeugen zu geringe Mengen mit signifikant verzerrter Darstellung. Das Kit enthält alle Reagenzien, die für die Zelllyse und anschließende Gesamtgenom-Amplifikation erforderlich sind. Einzelzellen können durch Fluorescence-activated Cell Sorting (FACS), Lasermikrodissektion, Verdünnung oder ein anderes geeignetes Verfahren isoliert werden.

Anwendung

Das GenomePlex® Einzelzell-Gesamtgenom-Amplifikations-Kit wird wie folgt verwendet:

  • zur Amplifikation der isolierten DNA
  • bei der Gesamtgenom-Amplifikation (GGA)
  • zur Amplifikation der mikrodissezierten DNA
  • zur Amplifikation von zirkulierender genomischer Tumorzellen-DNA aus kastrationsresistenten Prostatakarzinomzellen
  • für den Nachweis der Kopienzahlvariationen (CNV) durch Einzelzell-Gesamtgenomsequenzierung mit geringer Abdeckung (SLWGS)
  • Gelelektrophorese
  • qPCR
  • CGH-Microarray (vergleichende genomische Hybridisierung)
  • STR-Analyse
  • Einzelnukleotid-Polymorphismus(SNP)-Analyse

Leistungsmerkmale und Vorteile

  • Hohe Ausbeute und Genauigkeit der DNA-Amplifikation innerhalb von vier Stunden
  • Amplifikation von DNA aus jeder Quelle, zum Beispiel Krebszellen, Epithelzellen, Lymphozyten, amniotische Fibroblastenzellen, in Polycarbonat fixierte Zellen und Pflanzenzellen
  • Eine vollständige Darstellung des Gesamtgenoms mit minimaler allelischer Verzerrung
  • GGA-DNA-Polymerase eignet sich für die Verwendung mit Downstream-Anwendungen, Einschließlich Gelelektrophorese, qPCR, CGH-Microarray (vergleichende genomische Hybridisierung), STR-Analyse und Einzelnukleotid-Polymorphismus(SNP)-Analyse, TaqMan®-Assays und Mikrosatellitenanalyse

Sonstige Hinweise

Die Sequenzen der Universalprimer, die mit diesem Kit bereitgestellt werden, sind proprietär.

Rechtliche Hinweise

Die Verwendung dieses Produkts unterliegt einem oder mehreren der folgenden US-Patente und entsprechenden Patentansprüchen außerhalb der USA: 5.789.224, 5.618.711, 6.127.155 und Ansprüchen außerhalb der USA, die dem ausgelaufenen US-Patent Nr. 5.079.352 entsprechen. Der Erwerb dieses Produkts umfasst eine beschränkte, nicht übertragbare Immunität gegenüber Rechtsschutzverfahren gemäß den oben genannten Patentansprüchen für den ausschließlichen Gebrauch dieser Menge des Produktes für eigene interne Forschungsanwendungen des Käufers. Es wird weder ausdrücklich noch implizit oder durch Rechtsverwirkung ein Rechtsanspruch unter anderen Patentansprüchen ein Rechtsanspruch zur Erbringung kommerzieller Leistungen jeglicher Art übertragen, einschließlich, aber nicht beschränkt auf das Berichten der Ergebnisse aus den Aktivitäten des Käufers gegen Entgelt oder andere kommerzielle Gegenleistungen. Dieses Produkt ist nur für Forschungszwecke vorgesehen. Diagnostische Anwendungen nach Roche-Patentansprüchen erfordern eine gesonderte Lizenz von Roche. Weitere Informationen über den Erwerb von Lizenzen erhalten Sie vom Director of Licensing, Applied Biosystems, 850 Lincoln Centre Drive, Foster City, California, 94404, USA.
GenomePlex is a registered trademark of Takara Bio USA, Inc.
TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc.

Kit-Komponenten auch einzeln erhältlich

Produkt-Nr.
Beschreibung
SDB

  • L104310x Single Cell Lysis & Fragmentation BufferSDB

  • P4850Proteinase K from Tritirachium album, buffered aqueous glycerol solution, for molecular biology, ≥800 units/mLSDB

  • W4502Water, Nuclease-Free Water, for Molecular BiologySDB

Piktogramme

Health hazard

Signalwort

Danger

H-Sätze

Gefahreneinstufungen

Resp. Sens. 1

Lagerklassenschlüssel

10 - Combustible liquids

Flammpunkt (°F)

Not applicable

Flammpunkt (°C)

Not applicable


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Nathan R Treff et al.
Molecular human reproduction, 16(8), 583-589 (2010-05-21)
Many studies estimate that chromosomal mosaicism within the cleavage-stage human embryo is high. However, comparison of two unique methods of aneuploidy screening of blastomeres within the same embryo has not been conducted and may indicate whether mosaicism has been overestimated
Nathan R Treff et al.
Fertility and sterility, 94(6), 2017-2021 (2010-03-02)
To develop and validate a whole genome amplification and single nucleotide polymorphism (SNP) microarray protocol for accurate single cell 24 chromosome aneuploidy screening. Prospective, randomized, and blinded study. Academic reproductive medicine center. Multiple euploid and aneuploid cell lines were obtained
Resolving tumor heterogeneity: genes involved in chordoma cell development identified by low-template analysis of morphologically distinct cells
El-Heliebi A, et al.
PLoS ONE, 9(2), e87663-e87663 (2014)
Heike Fiegler et al.
Nucleic acids research, 35(3), e15-e15 (2006-12-21)
Heterogeneity in the genome copy number of tissues is of particular importance in solid tumor biology. Furthermore, many clinical applications such as pre-implantation and non-invasive prenatal diagnosis would benefit from the ability to characterize individual single cells. As the amount
Jochen B Geigl et al.
Nucleic acids research, 37(15), e105-e105 (2009-06-23)
Clinical DNA is often available in limited quantities requiring whole-genome amplification for subsequent genome-wide assessment of copy-number variation (CNV) by array-CGH. In pre-implantation diagnosis and analysis of micrometastases, even merely single cells are available for analysis. However, procedures allowing high-resolution

Artikel

Epigenetic modifications are thought to occur through two key interconnected processes—DNA methylation and the covalent modification of histones.

Protokolle

GenomePlex® is a Whole Genome Amplification (WGA) method that allows the researcher to generate a representative amplification of genomic DNA

Whole genome amplification (WGA) of plasma and serum DNA presents a unique challenge due to the small amount of nucleic acid in such samples.

This protocol provides a simple and convenient method to isolate, amplify, and purify genomic DNA from buccal swabs. Buccal swabs are a convenient method of acquiring a DNA sample.

Unser Team von Wissenschaftlern verfügt über Erfahrung in allen Forschungsbereichen einschließlich Life Science, Materialwissenschaften, chemischer Synthese, Chromatographie, Analytik und vielen mehr..

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