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一般說明
CpGenome Turbo亚硫酸氢盐修饰试剂盒旨在简化和精简亚硫酸氢盐修饰过程。该试剂盒包含用于亚硫酸氢盐修饰的所有关键试剂,以允许在约90分钟内回收修饰的DNA,而类似试剂盒的回收时间为3-16小时。这种快速但有效的方法采用了修饰试剂的专有混合物,以允许更短的转化时间。这种独特的试剂混合物可完全转化未甲基化的胞嘧啶,同时最大程度地减少对输入DNA的损害。修饰和脱磺化后,使用提供的旋转柱纯化和洗脱修饰的DNA,得到纯化的亚硫酸氢盐修饰的DNA,可用于各种下游应用。
关键特征
关键特征
- 在90分钟内将样品输入到修饰的DNA中
- 转化效率为99.9%
- 只有1 ng输入的DNA有效
- 只有25微升即可回收修饰的DNA
- 在多个下游应用中证明了性能
经5′端的胞嘧啶甲基化为鸟嘌呤对许多真核基因的表达具有深远的影响。在正常细胞中,甲基化主要发生在CG贫乏区域,而富含CG的区域(称为CpG岛)则保持未甲基化状态。其中例外的是,CpG岛的广泛甲基化与印记基因和女性无活性X染色体上的基因调节区的转录失活有关。在永生化和转化的细胞中,正常未甲基化的CpG岛的异常甲基化已被报道为一个相对频繁的事件,并且与人类癌症中已定义的肿瘤抑制基因的转录失活有关。
已经开发了几种方法来确定胞嘧啶的甲基化状态。这些包括使用抗体或蛋白质甲基结合结构域,用甲基化敏感的,不敏感的或依赖的限制酶消化,如限制性界标基因组扫描(RLGS),寡核苷酸阵列杂交,亚硫酸氢盐基因组DNA测序和甲基化特异性PCR(MSP)。
虽然基因组DNA测序耗时费力,但提供了更通用的检测方法。MSP是用于监测所选基因序列中异常基因甲基化的既定技术。该程序利用少量DNA,可灵敏并特异地检测启动子中的5-甲基胞嘧啶。它被用来定义肿瘤抑制基因的功能,并通过询问来自组织和体液的DNA为早期肿瘤检测提供新策略。
亚硫酸氢盐基因组测序和MSP的初始步骤是对DNA样品进行亚硫酸氢盐修饰。在亚硫酸氢盐反应中,所有未甲基化的胞嘧啶都被脱氨和磺化,将其转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶保持不变。因此,根据DNA最初是甲基化的还是未甲基化的,处理过的DNA的序列将有所不同。而且,最初互补的DNA链在胞嘧啶转化后将不再互补。基于这些化学诱导的差异,可以将用于MSP的引物设计为特异性扩增亚硫酸氢盐敏感的未甲基化链或抗亚硫酸氢盐的甲基化链。Millipore提供了一系列CpG Wiz MSP试剂盒,以实现MSP的基因特异性分析。要了解有关CpG Wiz试剂盒和MSP技术的更多信息请单击此处
已经开发了几种方法来确定胞嘧啶的甲基化状态。这些包括使用抗体或蛋白质甲基结合结构域,用甲基化敏感的,不敏感的或依赖的限制酶消化,如限制性界标基因组扫描(RLGS),寡核苷酸阵列杂交,亚硫酸氢盐基因组DNA测序和甲基化特异性PCR(MSP)。
虽然基因组DNA测序耗时费力,但提供了更通用的检测方法。MSP是用于监测所选基因序列中异常基因甲基化的既定技术。该程序利用少量DNA,可灵敏并特异地检测启动子中的5-甲基胞嘧啶。它被用来定义肿瘤抑制基因的功能,并通过询问来自组织和体液的DNA为早期肿瘤检测提供新策略。
亚硫酸氢盐基因组测序和MSP的初始步骤是对DNA样品进行亚硫酸氢盐修饰。在亚硫酸氢盐反应中,所有未甲基化的胞嘧啶都被脱氨和磺化,将其转化为尿嘧啶,而5-甲基胞嘧啶保持不变。因此,根据DNA最初是甲基化的还是未甲基化的,处理过的DNA的序列将有所不同。而且,最初互补的DNA链在胞嘧啶转化后将不再互补。基于这些化学诱导的差异,可以将用于MSP的引物设计为特异性扩增亚硫酸氢盐敏感的未甲基化链或抗亚硫酸氢盐的甲基化链。Millipore提供了一系列CpG Wiz MSP试剂盒,以实现MSP的基因特异性分析。要了解有关CpG Wiz试剂盒和MSP技术的更多信息请单击此处
成分
亚硫酸氢盐转化试剂1
亚硫酸氢盐转化试剂2
亚硫酸氢盐试剂稀释剂
DNA结合缓冲液
洗涤缓冲液NT3(浓缩液)*
洗脱缓冲液NE
改良的DNA纯化柱
2 mL收集管
*DNA洗涤缓冲液需要添加100%乙醇
亚硫酸氢盐转化试剂2
亚硫酸氢盐试剂稀释剂
DNA结合缓冲液
洗涤缓冲液NT3(浓缩液)*
洗脱缓冲液NE
改良的DNA纯化柱
2 mL收集管
*DNA洗涤缓冲液需要添加100%乙醇
法律資訊
CHEMICON is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
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訊號詞
Danger
危險分類
Acute Tox. 4 Inhalation - Acute Tox. 4 Oral - Aquatic Chronic 3 - Eye Dam. 1 - Met. Corr. 1 - Skin Corr. 1C
安全危害
儲存類別代碼
8A - Combustible corrosive hazardous materials
Cell reports, 19(9), 1846-1857 (2017-06-01)
2-hydroxyglutarate-(2-HG)-mediated inhibition of TET2 activity influences DNA hypermethylation in cells harboring mutations of isocitrate dehydrogenases 1 and 2 (IDH1/2). Here, we show that 2-HG also regulates DNA methylation mediated by DNA methyltransferase 1 (DNMT1). DNMT1-dependent hypermethylation of the RIP3 promoter
Characterization of induced tissue-specific stem cells from pancreas by a synthetic self-replicative RNA.
Scientific Reports null
BioTechniques, 55(4), 181-197 (2013-10-11)
Comprehensive analysis of DNA methylation patterns is critical for understanding the molecular basis of many human diseases. While hundreds of PCR-based DNA methylation studies are published every year, the selection and implementation of appropriate methods for these studies can be
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