Agaroza: Właściwości i zastosowania badawcze

Co to jest agaroza?

Agaroza to polisacharyd, który jest izolowany i oczyszczany z agaru lub alg morskich zawierających agar (wodorosty morskie). Jest to naturalny polimer, składający się z naprzemiennych jednostek β-D-galaktozy i 3,6-anhydro-L-galaktozy agarobiozy w swojej strukturze chemicznej. Liniowy polimer agarozy tworzy łańcuchy, które tworzą włókna, które są elastyczne i tworzą sieć kanałów o średnicy od 50 nm do 200 nm, w zależności od ilości użytej agarozy.

Jak używana jest agaroza?

Agaroza jest nietoksyczna i ma kilka właściwości i specyfikacji, które sprawiają, że jest przydatna jako środek żelujący w wielu zastosowaniach, takich jak elektroforeza kwasów nukleinowych, techniki immunodyfuzji, płytki żelowe lub nakładki na komórki w hodowli tkankowej, pożywki do hodowli komórkowej, chromatografia żelowa, chromatografia powinowactwa i chromatografia jonowymienna. Elektroforeza żelowa jest powszechną techniką laboratoryjną stosowaną w naukach przyrodniczych do ekstrakcji cząsteczek biologicznych na podstawie ich wielkości, na przykład w separacji DNA i wykrywaniu DNA.

Kluczowe właściwości agarozy

• Zawartość siarczanów - siarczany są główną obecną grupą jonową i dlatego są używane jako wskaźnik czystości.
• Siła żelu - siła, która musi być przyłożona do żelu, aby go złamać.
• Punkt żelu - temperatura, w której wodny roztwór agarozy tworzy żel po schłodzeniu. Roztwory agarozy wykazują histerezę podczas przejścia z cieczy do żelu. Innymi słowy, temperatura żelu nie jest taka sama jak temperatura topnienia.
• Elektroendosmoza (EEO) - odnosi się do przenoszenia cieczy przez żel. Grupy anionowe żelu agarozowego są przymocowane do matrycy i nie mogą migrować, podczas gdy dysocjujące przeciwkationy migrują do katody wewnątrz matrycy, generując EEO. Ponieważ elektroforeza biopolimerów odbywa się zwykle w kierunku anody, EEO może zakłócać separację przez konwekcję wewnętrzną.