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アミノ酸一覧表

アミノ酸はペプチドやタンパク質を構成する化合物で、いわばビルディングブロックです。どのアミノ酸も、アミノ基とカルボキシル基が四面体の炭素に結合してできています。この炭素をα炭素(アルファ炭素)と呼びます。

各アミノ酸は、R基と呼ばれる側鎖が異なっています。各アミノ酸のR基は、その構造、電荷、極性に差があります。

アミノ酸の特性、種類、用途、販売状況の詳細については、下記表およびリンク先をご覧ください。

  

疎水性側鎖を有するアミノ酸–脂肪族

  


 


 


荷電側鎖を有するアミノ酸–酸性

 


荷電側鎖を有するアミノ酸–塩基性

 



 

一般的なアミノ酸の特性

1 pKaは、-COOH基の解離定数の負の対数
2pKbは、-NH3基の解離定数の負の対数
3 pKxは、当該分子の上記以外の基の解離定数の負の対数
4plは、等電点のpH
参考文献:D.R.Lide, Handbook of Chemistry and Physics72nd Edition, CRC Press, Boca Raton, FL, 1991.

一般的なアミノ酸の疎水性インデックス

疎水性インデックスとは疎水性の相対値、すなわちアミノ酸が水にどれくらい溶けやすいかを示す指数です。疎水性アミノ酸はタンパク質の内部で見られる可能性が高いのに対し、親水性アミノ酸は水環境に接している可能性が高いです。

下記表は、グリシン残基の疎水性をニュートラル(値0)とし、疎水性が最も高い残基を100として数値化したものです。グリシンよりも親水性が高い残基については、外挿で求めました。

ApH 2 値:Sereda et al., J. Chrom.676: 139-153 (1994)から得た標準値
BpH 7 値:Monera et al., J. Protein Sci. 1: 319-329 (1995).

1.
Hayman M, Smith K, Cameron N, Przyborski S. 2005. Growth of human stem cell-derived neurons on solid three-dimensional polymers. Journal of Biochemical and Biophysical Methods. 62(3):231-240. https://doi.org/10.1016/j.jbbm.2004.12.001
2.
Cho IJ, Ahn JY, Kim S, Choi MS, Ha TY. 2008. Resveratrol attenuates the expression of HMG-CoA reductase mRNA in hamsters. Biochemical and Biophysical Research Communications. 367(1):190-194. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2007.12.140
3.
Polleux F, Ghosh A. 2002. The Slice Overlay Assay: A Versatile Tool to Study the Influence of Extracellular Signals on Neuronal Development. Science Signaling. 2002(136):pl9-pl9. https://doi.org/10.1126/stke.2002.136.pl9
4.
Rama Rao KV, Reddy PV, Tong X, Norenberg MD. 2010. Brain Edema in Acute Liver Failure. The American Journal of Pathology. 176(3):1400-1408. https://doi.org/10.2353/ajpath.2010.090756
5.
Marx M, Günter RH, Hucko W, Radnikow G, Feldmeyer D. 2012. Improved biocytin labeling and neuronal 3D reconstruction. Nat Protoc. 7(2):394-407. https://doi.org/10.1038/nprot.2011.449
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