プレデザインsiRNA

MISSION^®プレデザインsiRNAは、メルクの独占的提携パートナーであるRosetta Inpharmaticsが所有するsiRNA設計アルゴリズムを用いて作成しました。Rosetta siRNA設計アルゴリズムでは、位置特異的スコアリング行列とシード領域の情報を利用して、標的遺伝子の最も特異的かつ有効な配列を予測します。アルゴリズムの規則は、3年間の遺伝子サイレンシング実験で収集した経験的データを用いて作成しました。

製品の利点

• クラス最高レベルの保証付きの遺伝子サイレンシング
• 低発現遺伝子を効率的にノックダウン
• 11種類のポジティブコントロールsiRNAによる簡単なトランスフェクションの最適化
• 8種類のネガティブコントロールsiRNAによる配列特異的サイレンシングと非特異的サイレンシングの識別
• 機能性検証済みのプレデザインsiRNA

製品の特長

• 動物種：ヒト、マウス、ラット
• 保証収量（OD）：2 OD（10 nmol）、5 OD（25 nmol）、10 OD（50 nmol）
• 精製：脱塩またはHPLC
• 鎖長：dTdTオーバーハングを有する21 mer duplex
• 修飾：センス鎖上の5' amine
• 品質管理：100%質量分析
• 納品形態：チューブ入り乾燥品

 プール製品

プール品は、duplex 5 nmol 4本分を1本のチューブ（20 nmolのプール）にし、さらに同量のduplex 5 nmol 4本分を1本のチューブ（20 nmolの追加プール）にして計2本を納品される場合が多いです。しかし、私たちが開発した高度液体取扱装置は、上記以外の幅広い納品方法が可能です。具体的ニーズの対応可否については、customjp.ts@merckgroup.comにお問い合わせください。

バリデーション済みのsiRNA

mRNAが75%以上ノックダウンされたかどうか、一般的な標的遺伝子に対して多数検証しました（図1データの一例。発注が多い検証済みsiRNAの遺伝子記号順一覧表）。検証済みのsiRNAはトランスフェクション最適化に向いており、ポジティブコントロールに適しています。

図1. 濃度30 nMでプレデザインsiRNAを導入したHeLa細胞。遺伝子導入の48時間後の時点での遺伝子発現残存率をqPCRにより測定した (偽発現との比較)。データは生物学的レプリケート4つの平均を示す。

検証したsiRNA（遺伝子記号順）
ABCC1	CDC7	DYRK1A	IGFBP4	MLH1	PIK3R4	PRPS1	SIK2
ACP1	CDC73	DYRK1B	IL6ST	MSH2	PIM2	PRSS23	SLC16A1
ACP2	CDK1	EEF2K	ILK	MST4	PIN1	PSEN1	SLC25A17
ACVR1	CDK11B	EIF2AK4	IMPA2	MTA2	PINK1	PSEN2	SLC2A1
ACVR1B	CDK17	EIF4A3	INPPL1	MTM1	PIP4K2B	PSMA7	SLC30A1
ADAM10	CDK2	EMR2	IP6K1	MTMR1	PIP5K1A	PSMB4	SLK
ADAM12	CDK4	ENPP1	IP6K2	MTMR2	PKN2	PSMB5	SMU1
ADAM15	CDK5	EPHA5	IPMK	MTMR3	PLAUR	PSMB6	SNRK
ADIPOR1	CDK6	EPHB4	IRAK1	MTMR6	PLK1	PSPH	SORT1
ADIPOR2	CDK7	F3	IRAK4	MTOR	PLK4	PTK2	SRC
ADRBK1	CDK8	FADD	ITPK1	NADK	POLK	PTP4A1	SRPK1
AKT1	CDK9	FDFT1	JAK1	NCSTN	PPAP2C	PTPLA	ST7
AKT2	CDKL5	FER	JUND	NDRG1	PPAT	PTPN1	STAT3
ALPL	CDKN1B	FMNL1	JUP	NEDD8	PPM1D	PTPN11	STK16
APP	CDKN3	FURIN	LANCL1	NEK2	PPME1	PTPN12	STK24
ARAF	CELSR1	FYN	LATS1	NEK6	PPP1CA	PTPN14	STK3
ARHGDIA	CERK	FZD4	LDHA	NEK7	PPP1CB	PTPN23	STYX
ATF1	CHEK1	FZD5	LEPR	NEK9	PPP1CC	PTPN9	TAOK1
ATM	CHUK	FZD6	LGALS3	NET1	PPP1R11	PTPRE	TAOK3
ATP6V0C	CKS2	GLTSCR2	LIMK2	NF1	PPP1R12A	PTPRF	TBK1
ATR	CLPP	GPRC5A	LRP5	NLN	PPP1R2	PTPRJ	TEK
AURKB	CPE	GRB2	LRP6	NME1	PPP1R3C	PTPRK	TESK1
AXIN1	CPT1A	GRK6	LTBR	NME1-NME2	PPP1R7	PTPRS	TFRC
AXL	CRKL	GRN	LYN	NME2	PPP2CA	RAB22A	TGFBR1
BACE1	CSK	GSK3B	MAD2L1	NOTCH2	PPP2CB	RAF1	TGM1
BACE2	CSNK2A1	HADHB	MANF	NPR1	PPP2R1A	RAP1B	TGM2
BAD	CTNNB1	HBEGF	MAP2K2	NR1H2	PPP2R2A	RARG	THRA
BAG1	CTSA	HCG 1757335	MAP2K5	NR1H3	PPP2R5A	RB1	TK1
BCAT1	CXCR4	HDAC1	MAP3K3	NR2C2	PPP2R5D	RELA	TKT
BIRC5	CXCR7	HDAC2	MAP3K4	NR2F2	PPP2R5E	RHOA	TLR4
BMP6	CYLD	HECTD1	MAPK14	NUP85	PPP3CC	RIOK3	TM4SF1
BMPR1A	DAD1	HIPK2	MAPK3	OCRL	PPP5C	RIPK1	TNFRSF10B
BRAF	DAPK3	HIPK3	MAPK6	OXSR1	PPP6C	RIPK2	TRIM28
BUB1	DCN	HPRT1	MAPK8	PAK2	PREPL	RNF10	TWF1
BUB1B	DDR1	HSPA1A	MAPK9	PASK	PRKACA	RNF5	TYRO3
CASK	DGKA	HSPA1B	MAPKAPK5	PBK	PRKACB	ROCK1	VEGFC
CCL2	DMBT1	HSPB8	MARK3	PCNA	PRKAG1	ROCK2	VIPR1
CCNA2	DNMT1	HTRA1	MASTL	PCSK9	PRKAR1A	ROR2	VRK2
CCNC	DUSP10	HUNK	MBTPS1	PDE8A	PRKAR2A	RPS6KA3	WNK1
CCND1	DUSP11	ICAM1	MELK	PDGFRB	PRKCA	RPS6KA4	YES1
CCT2	DUSP12	ICK	MET	PDK1	PRKCI	RPS6KB1	ZMPSTE24
CD63	DVL2	IGF1R	MIF	PGK1	PRKCZ	RYK
CD82	DVL3	IGF2R	MINPP1	PHPT1	PRKDC	SHC1

引用文献の選択

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