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一般說明
对每批、每次的全部ChIPAb+抗体的染色质沉淀进行单独验证。每个ChIPAb+抗体组均包含对照引物(通过qPCR对每个批次进行检测),以在基因座特异性环境下对IP结果进行生物学验证。提供了qPCR方案和引物序列,使研究人员能够在染色质环境中使用我们的抗体时验证ChIP方案。每组还包括阴性对照抗体,以确保ChIP反应的特异性。
ChIPAb+乙酰基组蛋白H3(Lys18)组包括乙酰基组蛋白H3(Lys18)抗体,阴性对照正常兔血清和对照引物,可扩增人GAPDH启动子的166 bp区域。乙酰基组蛋白H3(Lys18)和阴性对照以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证乙酰基组蛋白H3(Lys18)相关染色质的沉淀。
ChIPAb+乙酰基组蛋白H3(Lys18)组包括乙酰基组蛋白H3(Lys18)抗体,阴性对照正常兔血清和对照引物,可扩增人GAPDH启动子的166 bp区域。乙酰基组蛋白H3(Lys18)和阴性对照以可扩展的“每个ChIP”反应大小提供,可用于功能上验证乙酰基组蛋白H3(Lys18)相关染色质的沉淀。
组蛋白H3是参与真核细胞染色质结构的5种主要组蛋白之一。H3具有一个主要的球状结构域和一个长N末端的尾巴,其与核糖体核小体′串珠′结构体的结构有关。
组蛋白H3的乙酰化发生在组蛋白尾部的几个不同的赖氨酸位置,并由称为组蛋白乙酰基转移酶(HATs)的酶家族完成。
组蛋白H3的乙酰化发生在组蛋白尾部的几个不同的赖氨酸位置,并由称为组蛋白乙酰基转移酶(HATs)的酶家族完成。
特異性
识别赖氨酸18乙酰化的组蛋白H3。
免疫原
KLH缀合的合成肽(GKAPRAcKQLASK-C),对应于在赖氨酸18上乙酰化的酵母组蛋白H3的氨基酸13-23,并添加了C端半胱氨酸便于进行缀合。
應用
染色质免疫沉淀:
代表性批次数据。
使用2 µL正常兔血清或2 µL抗乙酰化组蛋白H3(Lys18)和Magna ChIP® A试剂盒(目录号17-610),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 1 X 10E6细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用对人GAPDH启动子区域特异的对照引物作为阳性基因座,并使用β-珠蛋白引物作为阴性基因座,通过qPCR验证了乙酰基组蛋白H3(Lys18)相关DNA片段的成功免疫沉淀。 数据表示为每个IP样品相对于每个扩增子和ChIP样品的输入染色质的输入百分比。
请参阅EZ-Magna ChIP A(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号17-371)协议以获取实验详细信息。
ChIP-测序:
代表性批次数据。
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(目录号17-10460),2 µg抗三甲基组蛋白H3(Lys18)抗体(目录号17-10111),20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除 TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用 Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过1000万次读取。使用 MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从 BigWig 和 BED 文件在 UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。
蛋白质印迹分析:
代表性批次数据。
用抗乙酰基组蛋白H3(Lys18)(1:10,000稀释度)探测重组组蛋白H3(泳道1,目录号14-494)以及丁酸钠处理(泳道2)和未处理(泳道3)HeLa细胞(目录号17-305)的酸提取物。
箭头表示乙酰基组蛋白H3(Lys18)(17 kDa)。
斑点印迹:
代表性批次数据。
将40 ng和4 ng量的不同修饰的组蛋白肽(见表1)转移至PVDF膜上,并用抗乙酰基组蛋白H3(Lys18)抗体(1:5000稀释度)进行探测。使用与HRP偶联的山羊抗兔IgG和化学发光检测系统可视化蛋白质。显示了60秒曝光的图像。
代表性批次数据。
使用2 µL正常兔血清或2 µL抗乙酰化组蛋白H3(Lys18)和Magna ChIP® A试剂盒(目录号17-610),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 1 X 10E6细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用对人GAPDH启动子区域特异的对照引物作为阳性基因座,并使用β-珠蛋白引物作为阴性基因座,通过qPCR验证了乙酰基组蛋白H3(Lys18)相关DNA片段的成功免疫沉淀。 数据表示为每个IP样品相对于每个扩增子和ChIP样品的输入染色质的输入百分比。
请参阅EZ-Magna ChIP A(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号17-371)协议以获取实验详细信息。
ChIP-测序:
代表性批次数据。
使用Magna ChIP HiSens试剂盒(目录号17-10460),2 µg抗三甲基组蛋白H3(Lys18)抗体(目录号17-10111),20 µL蛋白A/G珠和1e6交联HeLa细胞染色质进行染色质免疫沉淀,然后使用磁珠纯化DNA。使用标准规程从Input和ChIP DNA样品制备文库,带Illumina条形码适配器,并在Illumina HiSeq仪器上进行分析。在去除 TagDust(http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource)标签后,使用 Bowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml)映射了FastQ文件中的超过1000万次读取。使用 MACS(http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/)识别峰,并从 BigWig 和 BED 文件在 UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu)中以自定义轨道的形式显示峰和读数。
蛋白质印迹分析:
代表性批次数据。
用抗乙酰基组蛋白H3(Lys18)(1:10,000稀释度)探测重组组蛋白H3(泳道1,目录号14-494)以及丁酸钠处理(泳道2)和未处理(泳道3)HeLa细胞(目录号17-305)的酸提取物。
箭头表示乙酰基组蛋白H3(Lys18)(17 kDa)。
斑点印迹:
代表性批次数据。
将40 ng和4 ng量的不同修饰的组蛋白肽(见表1)转移至PVDF膜上,并用抗乙酰基组蛋白H3(Lys18)抗体(1:5000稀释度)进行探测。使用与HRP偶联的山羊抗兔IgG和化学发光检测系统可视化蛋白质。显示了60秒曝光的图像。
研究子类别
组蛋白
组蛋白
研究类别
表观遗传学&核功能
表观遗传学&核功能
该ChIPAb+乙酰基组蛋白H3(Lys18)ChIP验证的抗体&引物组方便地包括抗体 &特异性对照PCR引物。
包裝
每组25次测定。推荐用于:每次染色质免疫沉淀约2 μL抗体(取决于生物学背景)。
品質
染色质免疫沉淀:
代表性批次数据。
使用2 µL正常兔血清或2 µL抗乙酰化组蛋白H3(Lys18)和Magna ChIP® A试剂盒(目录号17-610),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 1 X 10E6细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用对人GAPDH启动子区域特异的对照引物,通过qPCR验证了乙酰基组蛋白H3(Lys18)相关DNA片段的成功免疫沉淀(图1)。
有关实验详细信息,请参阅EZ-Magna ChIPA(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号17-371)方案。
代表性批次数据。
使用2 µL正常兔血清或2 µL抗乙酰化组蛋白H3(Lys18)和Magna ChIP® A试剂盒(目录号17-610),对从HeLa细胞制备的超声染色质(每IP 1 X 10E6细胞当量)进行染色质免疫沉淀。 使用对人GAPDH启动子区域特异的对照引物,通过qPCR验证了乙酰基组蛋白H3(Lys18)相关DNA片段的成功免疫沉淀(图1)。
有关实验详细信息,请参阅EZ-Magna ChIPA(目录号17-408)或EZ-ChIP(目录号17-371)方案。
標靶描述
17 kDa
外觀
抗-乙酰基组蛋白H3(Lys18)(兔多克隆)。一个小瓶含有50 µL兔血清(含0.05%叠氮化钠和30甘油)。储存在-20°C。
正常兔血清。一个小瓶含有100 μL抗血清(含0.05%叠氮化钠)。储存于-20°C。
对照引物,人GAPDH启动子。一个小瓶,包含75 μL 5 μM人GAPDH启动子特异性引物。储存于-20°C。
对于:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV: TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA
正常兔血清。一个小瓶含有100 μL抗血清(含0.05%叠氮化钠)。储存于-20°C。
对照引物,人GAPDH启动子。一个小瓶,包含75 μL 5 μM人GAPDH启动子特异性引物。储存于-20°C。
对于:TAC TAG CGG TTT TAC GGG CG
REV: TCG AAC AGG AGG AGC AGA GAG CGA
儲存和穩定性
自收到之日起在-20°C可稳定保存1年。处理建议:第一次融化后,在取下瓶盖之前,将小瓶离心并轻轻混合溶液。分装到微量离心管中,并储存于-20°C。避免反复冻融,其可能会破坏IgG并影响产品性能。注意:冷藏室温度变化至低于-20°C时可能导致含甘油的溶液在储存过程中冻结。
分析報告
对照
包括阴性对照正常兔血清和对人GAPDH启动子特异性的引物。
包括阴性对照正常兔血清和对人GAPDH启动子特异性的引物。
法律資訊
MAGNA CHIP is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany
免責聲明
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儲存類別代碼
10 - Combustible liquids
Bioscience reports, 37(5) (2017-09-25)
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