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Merck

B0300

Sigma-Aldrich

Betain -Lösung

5 M, PCR Reagent

Synonym(e):

TMG, trimethylglycine

Anmeldenzur Ansicht organisationsspezifischer und vertraglich vereinbarter Preise


About This Item

Lineare Formel:
(CH3)3N+CH2COO
CAS-Nummer:
Molekulargewicht:
117.15
Beilstein:
3537113
MDL-Nummer:
UNSPSC-Code:
12352200
PubChem Substanz-ID:

Qualität

PCR Reagent

Qualitätsniveau

Form

liquid

Verpackung

vial of 1.5 mL

Konzentration

5 M

Methode(n)

PCR: suitable

Farbe

colorless

Anwendung(en)

agriculture

Fremdaktivität

DNase, RNase, none detected

Lagertemp.

2-8°C

SMILES String

C[N+](C)(C)CC([O-])=O

InChI

1S/C5H11NO2/c1-6(2,3)4-5(7)8/h4H2,1-3H3

InChIKey

KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N

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Allgemeine Beschreibung

Betain, auch als Trimethylglycin oder N,N,N-Triethylammoniumacetat bezeichnet, ist ein Analogon von Glycin mit drei Methylgruppen. Es ist mit Polymerase-Kettenreaktion(PCR)-Puffermischungen hochgradig kompatibel. Betain ist ein verstärkendes Reagenz für die PCR, das häufig zur Verbesserung der Ausbeute und Spezifität von PCR-Produkten eingesetzt wird, insbesondere bei der PCR-Amplifikation von Zielen mit hohem GC-Gehalt oder Zielen, die Sekundärstrukturen bilden, was zu einer schlechten Ausbeute führt. Betain ermöglicht die Trennung der DNA-Stränge und reguliert den Unterschied in der Schmelztemperatur (Tm) zwischen GC- und AT-Paaren in DNA. Es stabilisiert die ds-DNA durch Ausgleich des Beitrags von GC- und AT-Basenpaaren. Betain wird in großem Umfang zur Optimierung der Multiplex-PCR und der LA-PCR (LA = long and accurate/lang und genau) eingesetzt. Berichten zufolge wird die Abhängigkeit der Basenpaarzusammensetzung vom Schmelzen des DNA-Strangs durch die Zugabe von 1,0–1,7 M wässrigem Betain zu einer PCR-Mischung reduziert.

Anwendung

Betainlösung wird als Komponente der Reaktionsmischung für Folgendes verwendet:
  • LAMP-Reaktionen (loop-mediated isothermal amplification)
  • Polymerase-Kettenreaktion für die Amplifikation von genomischer DNA
  • quantitative Polymerase-Kettenreaktion (qPCR) für die Telomerlängenanalyse
  • bei der PCR-Amplifikation von CGG-Wiederholungen in der genomischen DNA
  • Reverse-Transkription-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) zum Nachweis von SARS-assoziiertem Coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
  • PCR-Amplifikation der größten Untereinheit von DNA-gesteuerter RNA-Polymerase II (RPB2)
  • reverse Transkription während der Bibliothekserstellung mit Smartseq2

Verpackung

1,5 ml pro Fläschchen

Lagerklassenschlüssel

12 - Non Combustible Liquids

WGK

WGK 1

Flammpunkt (°F)

Not applicable

Flammpunkt (°C)

Not applicable


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Thirty-minute screening of antibiotic resistance genes in bacterial isolates with minimal sample preparation in static self-dispensing 64 and 384 assay cards
Kostic T, et al.
Applied Microbiology and Biotechnology, 99(18), 7711-7722 (2015)
Molecular characterization of X chromosome fragility in idiopathic mental retardation
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DMSO and betaine greatly improve amplification of GC-rich constructs in de novo synthesis
Jensen, Michael A and Fukushima, Marilyn and Davis, Ronald W
PLoS ONE, 5(6), e11024-e11024 (2010)
P N Hengen
Trends in biochemical sciences, 22(6), 225-226 (1997-06-01)
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Betaine chemistry, roles, and potential use in liver disease
Day CR and Kempson SA
Biochimica et biophysica acta. General subjects, 1860(6), 1098-1106 (2016)

Protokolle

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Protocol for high fidelity amplification of long PCR fragments up to 22kb from complex DNA mixtures and up to 40kb from simple DNA mixtures. Red dye allows direct loading of reaction on a gel. REDAccuTaq LA

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