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Merck

C9137

Sigma-Aldrich

Cordycepin-5′-triphosphat Natriumsalz

≥95%

Synonym(e):

3′-Desoxy-ATP, 3′-dATP, 3′-Desoxyadenosin-5′-triphosphat

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About This Item

Empirische Formel (Hill-System):
C10H16N5O12P3
CAS-Nummer:
Molekulargewicht:
491.18
MDL-Nummer:
UNSPSC-Code:
41106305
PubChem Substanz-ID:
NACRES:
NA.51

Assay

≥95%

Form

powder

Mol-Gew.

491.18  g/mol

Lagertemp.

−20°C

SMILES String

[Na].Nc1ncnc2n(cnc12)C3OC(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)CC3O

InChI

1S/C10H16N5O12P3.Na.H/c11-8-7-9(13-3-12-8)15(4-14-7)10-6(16)1-5(25-10)2-24-29(20,21)27-30(22,23)26-28(17,18)19;;/h3-6,10,16H,1-2H2,(H,20,21)(H,22,23)(H2,11,12,13)(H2,17,18,19);;

InChIKey

FRGBONDYLMUOMH-UHFFFAOYSA-N

Allgemeine Beschreibung

Cordycepin (3′-desoxyadenosin) ist ein cytotoxisches Adenosinanalogon und ein aus Cordyceps militaris extrahiertes bioaktives Mittel. Cordycepin-5′-triphosphat ist ein toxisches Derivat von Cordycepin.

Anwendung

Cordycepin-5′-triphosphatnatriumsalz wird wie folgt verwendet:
  • als Transkriptionshemmer bei RNA-Zerfallassays
  • zur Hemmung der Polyadenylierung in HEK293T-Zellen vor der Entnahme für In-vitro-Interaktionsstudien durch Co-Immunpräzipitation (co-Ips)
  • als Positivkontrolle bei In-vitro-Assays für die Polymerasehemmung
  • als Vorläufer bei der Produktion von Cordycepinmonophosphat

Biochem./physiol. Wirkung

Cordycepin weist verschiedene Stoffwechselwirkungen durch Aktivierung von AMP-aktivierter Proteinkinase (AMPK) beim Menschen auf. Cordycepintriphosphat hemmt die polymerasespezifische RNA-Synthese im Picornavirus durch Blockieren des [3H]GMP-Einbaus in vitro. Es verzögert auch das Zellwachstum durch Hemmen der RNA-Synthese.
Cordycepin-5′-triphosphat wird durch Poly(A)-Polymerase in Nukleinsäure eingebunden. Da ihm eine 3′-Hydroxygruppekettenproduktion fehlt, kann es für die Markierung von RNA am 3′-Ende eingesetzt werden.

Piktogramme

Health hazardExclamation mark

Signalwort

Warning

Gefahreneinstufungen

Acute Tox. 4 Oral - Carc. 2 - Eye Irrit. 2 - Skin Irrit. 2 - STOT SE 3

Zielorgane

Respiratory system

Lagerklassenschlüssel

11 - Combustible Solids

WGK

WGK 3

Persönliche Schutzausrüstung

Eyeshields, Gloves, type P3 (EN 143) respirator cartridges


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Ming Wei Chen et al.
Antiviral research, 143, 38-47 (2017-04-10)
Chikungunya virus (CHIKV) is an important arboviral infectious agent in tropical and subtropical regions, often causing persistent and debilitating disease. The viral enzyme non-structural protein 4 (nsP4), as RNA-dependent RNA polymerase (RdRP), catalyzes the formation of negative-sense, genomic and subgenomic
Martin M Gossner et al.
Nature, 540(7632), 266-269 (2016-12-06)
Land-use intensification is a major driver of biodiversity loss. Alongside reductions in local species diversity, biotic homogenization at larger spatial scales is of great concern for conservation. Biotic homogenization means a decrease in β-diversity (the compositional dissimilarity between sites). Most
3′-end labeling of RNA with recombinant yeast poly(A) polymerase.
Lingner J, Keller W.
Nucleic Acids Research, 25, 2917-2920 (1993)
D L Panicali et al.
Journal of virology, 25(1), 124-128 (1978-01-01)
Cordycepin triphosphate inhibited in vitro [3H]GMP incorporation by pricornavirus-specific polymerase complexes isolated from infected HeLa cells. The inhibition of [3H]GMP incorporation could be reversed with ATP added to the reaction mixture along with the inhibitor, but not with GTP so
Nicole Montreau et al.
Comptes rendus biologies, 326(12), 1135-1147 (2004-01-30)
Using an in vivo heterologous system to study the stability of Xenopus laevis RNA injected into axolotl (Ambystoma mexicanum) fertilized eggs, we have previously observed unexpected fluctuations in RNA level during early development [Andéol et al., Differentiation 63 (1998) 69-79].

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