MABE1073

Anti-Acetyl-SMC3-Antikörper (Lys105/106), Klon 21A7

clone 21A7, from mouse

• Synonym(e): Structural maintenance of chromosomes protein 3, Lys105/106 acetylated, Bamacan, Lys105/106 acetylated, Basement membrane-associated chondroitin proteoglycan, Lys105/106 acetylated, Chondroitin sulfate proteoglycan 6, Lys105/106 acetylated, Chromosome-as
• UNSPSC-Code: 12352203
• eCl@ss: 32160702
• NACRES: NA.41

Eigenschaften

• Biologische Quelle: mouse
• Qualitätsniveau: 100
• Antikörperform: purified immunoglobulin
• Antikörper-Produkttyp: primary antibodies
• Klon: 21A7, monoclonal
• Speziesreaktivität: human
• Speziesreaktivität (Voraussage durch Homologie): nonhuman primates (based on 100% sequence homology), Xenopus (based on 100% sequence homology), bovine (based on 100% sequence homology), mouse (based on 100% sequence homology), rat (based on 100% sequence homology)
• Methode(n): ChIP: suitable (ChIP-seq); ELISA: suitable; western blot: suitable
• Isotyp: IgG2bκ
• NCBI-Hinterlegungsnummer: NP_005436
• UniProt-Hinterlegungsnummer: Q9UQE7
• Versandbedingung: ambient
• Posttranslationale Modifikation Target: acetylation (Lys105/Lys106)
• Angaben zum Gen: human ... SMC3(9126)

Beschreibung

Allgemeine Beschreibung

Structural maintenance of chromosomes protein 3 (UniProt Q9UQE7; auch als Bamacan, Basement membrane-associated chondroitin proteoglycan, Chondroitin sulfate proteoglycan 6, Chromosome-associated polypeptide, hCAP, SMC-Protein 3, SMC-3) wird beim Menschen durch das SMC3-Gen (auch als BAM, BMH, CDLS3, CSPG6, SMC3L1 bekannt, Gen-ID 9126) kodiert. Cohesin ist ein dreiteiliger Kernkomplex, der aus Rad21 und zwei SMC-Proteinen (Structural maintenance of chromosomes protein), SMC1 und SMC3, besteht. Cohesin spielt eine wichtige Rolle bei der Kohäsion von Schwesterchromatiden sowie bei der DNA-Reparatur und Genexpressionsregulation. Um während der S-Phase eine Kohäsion von Schwesterchromatiden zu bilden, wird SMC3 durch zwei Cohesin-Acetyltransferasen (CoAT), ESCO1 und ESCO2, die sich durch ihre N-terminalen Domänen und Expression während der Entwicklung sowie über den Zellzyklus hinweg unterscheiden, acetyliert (beim Mensch an K105 und K106). Eine ChIP-Seq-Analyse zeigt, dass ESCO1 durch Cohesin an mehr als 11.000 Stellen rekrutiert wird, die von Cohesin und CTCF besetzt werden, das langweitreichende Chromatin-Wechselwirkungen vermittelt und die universelle Transkription reguliert. Andererseits wird ESCO2 unregelmäßig an Stellen angereichert, auf die REST/NRSF (RE1-silencing transcription factor/neuron-restrictive silencer factor) abzielt, der die Transkription von neuronenspezifischen Genen unterdrückt. Es wird angenommen, dass die SMC3-Acetylierung konformationelle Änderungen der dimeren Gelenkstruktur während der S-Phase einleitet und das Öffnen des Dimers sowie Beladen von DNA ermöglicht.

Spezifität

Klon 21A7 band Lys105/106-diacetyliertes SMC3-Peptid mit zweifach höherer Affinität als Lys105-monoacetyliertes SMC3-Peptid (Kd = 0,04 bzw. 0,09 µg/ml), zeigte jedoch eine deutlich reduzierte Affinität für Lys105-monoacetyliertes (Kd = 0,73 µg/ml) und kaum Affinität für nichtacetyliertes (Kd = 2,99 µg/ml) Peptid (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Immunogen

An KLH konjugiertes lineares Peptid, das der Zielregionsequenz von SMC3 mit acetyliertem Lys105 und Lys106 von Mensch/Maus/Ratte entspricht.

Anwendung

Anti-Acetyl-SMC3 (Lys105/106), Klon 21A7, Katalognr. MABE1073. ist ein hochspezifischer monoklonaler Maus-Antikörper, der auf die SMC3-Lys105/106-Acetylierung abzielt und in Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP), ChIP-seq, ELISA und Western Blot geprüft wurde.

ELISA-Analyse: Eine repräsentative Charge band Lys105/106-diacetyliertes SMC3-Peptid mit zweifach höherer Affinität als Lys105-monoacetyliertes SMC3-Peptid (Kd = 0,04 bzw. 0,09 µg/ml), zeigte jedoch eine deutlich reduzierte Affinität für Lys105-monoacetyliertes (Kd = 0,73 µg/ml) und kaum Affinität für nichtacetyliertes (Kd = 2,99 µg/ml) Peptid (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP)-Analyse: Eine repräsentative Charge wies eine erhöhte SMC3-Anwesenheit an Zielchromatinstellen in HDAC8-Null-HCT116-Zellen als in Wildtyp-HCT-116-Zellen nach (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

ChIP-seq-Analyse: Eine repräsentative Charge wies SMC3-Chromosom 11-Anreicherungsstellen, einschließlich 81 % der Rad21-Zielstellen und 70 % der Esco1-Zielstellen, durch ChIP-seq nach (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Western-Blot-Analyse: Eine repräsentative Charge wies SMC3-Lys105/106-Acetylierung in HeLa-Zellen nach. ESCO1- oder ESCO2-Abbau durch eine shRNA-Behandlung reduzierte das Maß an SMC3-Lys105/106-Acetylierung, während ein doppelter ESCO1/2-Abbau zur stärksten Reduktion der SMC3-Lys105/106-Acetylierung führte (Rahman, S., et al. (2015). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 112(36):11270-11275).

Forschungskategorie
Epigenetik & Zellkernfunktion

Qualität

Beurteilt mittels Western Blot an humanen Retinaepithelpigment(REP)-Zellen.

Western-Blot-Analyse: Eine 1:1.000-Verdünnung dieses Antikörpers wies eine reduzierte SMC3-Lys105/106-Acetylierung in 10 µg Lysat aus humanen N-Acetyltransferase-ESCO1-Knockout-Retinaepithelpigment (REP)-Zellen als in Lysat von Wildtyp-REP-Zellen nach.

Zielbeschreibung

~ 160 kDa gemessen. 142,0/141,5/141,6/138,4/140,7 kDa (Rind/Mensch/Maus/Ratte/Krallenfrosch) berechnet. In manchen Lysaten können nichtcharakterisierte Banden auftreten.

Physikalische Form

Aufgereinigtes Maus-IgG2b in Puffer mit 0,1 mol/l Tris-Glycin (pH-Wert 7,4), 150 mmol/l NaCl mit 0,05 % Natriumazid.

Format: Aufgereinigt

Über Protein G aufgereinigt.

Lagerung und Haltbarkeit

Bei 2–8 °C ab Empfangsdatum 1 Jahr haltbar.

Sonstige Hinweise

Konzentration: Die Konzentration entnehmen Sie bitte dem chargenspezifischen Datenblatt.

Haftungsausschluss

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Sicherheitshinweise

• Lagerklassenschlüssel: 12 - Non Combustible Liquids
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