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G115000

Sigma-Aldrich

DMT-dG(dmf) Phosphoramidite

≥99.0% (reversed phase HPLC)

Sinonimo/i:

DMT-dG(dmf) Amidite, N-[(dimethylamino)methylene]-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxyguanosine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite], N2-Dimethylformamidine-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-deoxyguanosine-3′-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N′-diisopropylphosphoramidite]

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About This Item

Formula empirica (notazione di Hill):
C43H53N8O7P
Numero CAS:
Peso molecolare:
824.90
Numero MDL:
Codice UNSPSC:
12352200
ID PubChem:
NACRES:
NA.51

Tipo

for DNA synthesis

Livello qualitativo

Nome Commerciale

Proligo Reagents

Saggio

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

Forma fisica

powder

PM

824.90 g/mol

tecniche

oligo synthesis: suitable

Colore

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

Profilo del nucleoside

base: deoxyguanosine
base protecting group: DMF
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: fast

Temperatura di conservazione

-10 to -25°C

Stringa SMILE

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4C(=O)NC(\N=C/N(C)C)=Nc34)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C43H53N8O7P/c1-29(2)51(30(3)4)59(56-24-12-23-44)58-36-25-38(50-28-45-39-40(50)47-42(48-41(39)52)46-27-49(5)6)57-37(36)26-55-43(31-13-10-9-11-14-31,32-15-19-34(53-7)20-16-32)33-17-21-35(54-8)22-18-33/h9-11,13-22,27-30,36-38H,12,24-26H2,1-8H3,(H,47,48,52)/b46-27-/t36-,37+,38+,59?/m0/s1
YRQAXTCBMPFGAN-UJASEYITSA-N

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Descrizione generale

DMT-dG(dmf) Phosphoramidite belongs to fast deprotection phosphoramidites where the deprotection step of automated oligonucleotide synthesis is integral to synthesis time and final product quality. Changing the dG protecting group to the dimethylformamidine (dmf) baseprotecting group enables the rapid synthesis of high-purity, high-yield oligonucleotide, thus increasing the efficiency of high-throughput production.

Caratteristiche e vantaggi

Key Features of dG(dmf):
  • dG(dmf) is deprotected faster than the conventional dG(ib): the deprotection time in concentrated ammonia is reduced to 2 hours at 55 °C or 1 hour at 65 °C
  • The dG(dmf)-monomer is especially suitable for G-rich sequences: incomplete deprotection is greatly reduced in comparison with the conventional dG(ib)-monomer
  • dG(dmf)-phosphoramidite is as stable in solution as the standard dA(bz)-, dC(bz)- and dT-phosphoramidites
  • dG(dmf)-phosphoramidite can directly substitute for dG(ib)-phosphoramidite
  • No change is required in the reagents commonly used for DNA synthesis (Except a low concentration iodine oxidizer i.e., 0.02 M in iodine, should be employed)

Codice della classe di stoccaggio

11 - Combustible Solids

Classe di pericolosità dell'acqua (WGK)

WGK 3

Punto d’infiammabilità (°F)

Not applicable

Punto d’infiammabilità (°C)

Not applicable


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