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C11100P

Sigma-Aldrich

DMT-dC(bz) Pharmadite®

Sinonimo/i:

DMT-dC(bz) Phosphoramidite, N-benzoyl-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxycytidine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-?bis(1-methylethyl)phosphoramidite]

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About This Item

Formula empirica (notazione di Hill):
C46H52N5O8P
Peso molecolare:
833.91
Numero MDL:
Codice UNSPSC:
12352200
ID PubChem:
NACRES:
NA.51

Origine biologica

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Livello qualitativo

Tipo

for DNA synthesis

Nome Commerciale

Proligo Reagents

Saggio

≥99.5% (reversed phase HPLC)
>99.5% (31P-NMR)

Forma fisica

powder or granules

tecniche

oligo synthesis: suitable

Impurezze

>= 170ppm, none detected (S/N <2.5)
≤0.1% P(III) 100-169ppm (31P-NMR)
≤0.1% single unspecified Imprity (reversed phase HPLC)
≤0.3% dC2 (reversed phase HPLC, DMT-dC(bz) cyanoethyl-H-posphonate)
≤0.3% dC3 (reversed phase HPLC, DMT-dC(bz) phosphoramidate)
≤0.3% dC5 (reversed phase HPLC, O3′-Benzoyl-O5′-DMT-dC(bz))
≤0.30 wt. % water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(V) -25-99ppm (31P-NMR)
≤3.0 wt. % residual solvent content

Colore

white to off-white

Solubilità

soluble, clear

Compatibilità

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

Profilo del nucleoside

base: deoxycytidine
base protecting group: benzoyl
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

Temperatura di conservazione

2-8°C

Stringa SMILE

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(NC(=O)c4ccccc4)=NC3=O)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C46H52N5O8P/c1-32(2)51(33(3)4)60(57-29-13-27-47)59-40-30-43(50-28-26-42(49-45(50)53)48-44(52)34-14-9-7-10-15-34)58-41(40)31-56-46(35-16-11-8-12-17-35,36-18-22-38(54-5)23-19-36)37-20-24-39(55-6)25-21-37/h7-12,14-26,28,32-33,40-41,43H,13,29-31H2,1-6H3,(H,48,49,52,53)/t40-,41+,43+,60?/m0/s1
PGTNFMKLGRFZDX-SALLYJDFSA-N

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Descrizione generale

DMT-dC(bz) Pharmadite® is a Pharmadite® product line that represents a new class of standard protected DNA phosphoramidites designed with highly controlled impurity profiles and exceptional overall purity.Pharmadite phosphoramidites are characterized by their exceptional purity and well-defined impurity profile. In particular, they are essentially free fromcontaminants that interfere in coupling reactions, such as other nucleosidic or non-nucleosidic phosphoramidites (P(III)-contaminants). All remainingimpurities in Pharmadite phosphopramidites, if present, are identified, characterized, and quantified. The impact of any such defined impurities on the synthesis of oligonucleotides is well understood and has been shown to be insignificant.

Note legali

Pharmadite is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Codice della classe di stoccaggio

11 - Combustible Solids

Classe di pericolosità dell'acqua (WGK)

WGK 1

Punto d’infiammabilità (°F)

Not applicable

Punto d’infiammabilità (°C)

Not applicable


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