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G211200

Sigma-Aldrich

DMT-2′Fluoro-dG(ib) Phosphoramidite

Synonyme(s) :

DMT-2′Fluoro-dG(ib) Amidite

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About This Item

Formule empirique (notation de Hill):
C44H53FN7O8P
Numéro CAS:
Poids moléculaire :
857.91
Numéro MDL:
Code UNSPSC :
41116105
ID de substance PubChem :
Nomenclature NACRES :
NA.51

Source biologique

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Gamme de produits

Proligo Reagents

Pureté

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

Forme

powder

Technique(s)

oligo synthesis: suitable

Impuretés

≤0.3% water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR)
≤0.5% single Impurity (reversed phase HPLC)
≤3% residual Solvent content

Couleur

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

Adéquation

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

Profil des nucléosides

base: deoxyguanosine
base protecting group: isobutyryl
2' protecting group: fluoro
5' protecting group: DMT
deprotection: fast/standard

Température de stockage

−20°C

Chaîne SMILES 

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H]([C@H](F)[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4C(=O)NC(NC(=O)C(C)C)=Nc34)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C44H53FN7O8P/c1-27(2)40(53)49-43-48-39-37(41(54)50-43)47-26-51(39)42-36(45)38(60-61(58-24-12-23-46)52(28(3)4)29(5)6)35(59-42)25-57-44(30-13-10-9-11-14-30,31-15-19-33(55-7)20-16-31)32-17-21-34(56-8)22-18-32/h9-11,13-22,26-29,35-36,38,42H,12,24-25H2,1-8H3,(H2,48,49,50,53,54)/t35-,36-,38-,42-,61?/m1/s1

Clé InChI

KJFUMXZZVYMQEU-AOCJBPQJSA-N

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Description générale

DMT-2′Fluoro-dG(ib) Phosphoramidite is a 2′Fluoro phosphoramidite that is used to synthesize oligonucleotides that are more thermally stable and provide increased nuclease resistance.

Its key features include,

  • Can be employed together with DNA or RNA phosphoramidites
  • Recommended deprotection conditions are 8 hours at 55 °C using concentrated ammonia solution, or with AMA for 10 minutes at 65 °C
  • Synthesis of 2′Fluoro oligonucleotides is similar to standard DNA synthesis but requires an elongated coupling time (recommended is 3 minutes compared to 90 seconds for DNA monomers)
  • Consistent lot-to-lot high purity and performance
  • Manufactured under a certified ISO 9001 quality system

Application

DMT-2′Fluoro-dG(ib) Phosphoramidite is suitable for use in the synthesis of 2′-fluoro-modified oligonucleotide sequences using automated solid-phase chemistry.

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 3

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


Certificats d'analyse (COA)

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