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G115060

Sigma-Aldrich

DMT-dG(dmf) Phosphoramidite

configured for ABI

Synonyme(s) :

DMT-dG(dmf) Amidite, N-[(dimethylamino)methylene]-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxyguanosine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite], N2-Dimethylformamidine-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2′-deoxyguanosine-3′-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N′-diisopropylphosphoramidite]

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About This Item

Formule empirique (notation de Hill):
C43H53N8O7P
Numéro CAS:
Poids moléculaire :
824.90
Numéro MDL:
Code UNSPSC :
12352200
ID de substance PubChem :
Nomenclature NACRES :
NA.51

Type

for DNA synthesis

Niveau de qualité

Gamme de produits

Proligo Reagents

Pureté

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

Forme

powder

Technique(s)

oligo synthesis: suitable

Couleur

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

Compatibilité

configured for ABI

Profil des nucléosides

base: deoxyguanosine
base protecting group: DMF
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: fast/standard

Température de stockage

-10 to -25°C

Chaîne SMILES 

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)n3cnc4C(=O)NC(\N=C/N(C)C)=Nc34)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C43H53N8O7P/c1-29(2)51(30(3)4)59(56-24-12-23-44)58-36-25-38(50-28-45-39-40(50)47-42(48-41(39)52)46-27-49(5)6)57-37(36)26-55-43(31-13-10-9-11-14-31,32-15-19-34(53-7)20-16-32)33-17-21-35(54-8)22-18-33/h9-11,13-22,27-30,36-38H,12,24-26H2,1-8H3,(H,47,48,52)/b46-27-/t36-,37+,38+,59?/m0/s1

Clé InChI

YRQAXTCBMPFGAN-UJASEYITSA-N

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Description générale

"Proligo′s DNA phosphoramidites lead to high-yield and high-quality oligonucleotides due to their high coupling efficiency. The deprotection step of automated oligonucleotide synthesis is integral to synthesis time and final product quality. The high coupling efficiency of Proligo′s DNA phosphoramidites leads to high-yield and high-quality oligonucleotides.Changing the dG protecting group to the dimethylformamidine (dmf) baseprotecting group enables the rapid synthesis of high-purity, high-yieldoligonucleotide, thus increasing the efficiency of high-throughputproduction.Key Features of dG(dmf) :

  • dG(dmf) is deprotected faster than the conventional dG(ib): thedeprotection time in concentrated ammonia is reduced to 2 hours at55 °C or 1 hour at 65 °C
  • The dG(dmf)-monomer is especially suitable for G-rich sequences:incomplete deprotection is greatly reduced in comparison with theconventional dG(ib)-monomer
  • dG(dmf)-phosphoramidite is as stable in solution as the standard dA(bz)-,dC(bz)- and dT-phosphoramidites
  • dG(dmf)-phosphoramidite can directly substitute for dG(ib)-phosphoramidite
  • No change is required in the reagents commonly used for DNA synthesis(except a low concentration iodine oxidizer i.e., 0.02 M in iodine, should beemployed)DMT-dG(dmf) Phosphoramidite is configured for ABI Synthesizers."

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 3

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


Certificats d'analyse (COA)

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