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C11100P

Sigma-Aldrich

DMT-dC(bz) Pharmadite®

Synonyme(s) :

DMT-dC(bz) Phosphoramidite, N-benzoyl-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-deoxycytidine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-?bis(1-methylethyl)phosphoramidite]

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About This Item

Formule empirique (notation de Hill):
C46H52N5O8P
Poids moléculaire :
833.91
Numéro MDL:
Code UNSPSC :
12352200
ID de substance PubChem :
Nomenclature NACRES :
NA.51

Source biologique

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Niveau de qualité

Type

for DNA synthesis

Gamme de produits

Proligo Reagents

Pureté

≥99.5% (reversed phase HPLC)
>99.5% (31P-NMR)

Forme

powder or granules

Technique(s)

oligo synthesis: suitable

Impuretés

>= 170ppm, none detected (S/N <2.5)
≤0.1% P(III) 100-169ppm (31P-NMR)
≤0.1% single unspecified Imprity (reversed phase HPLC)
≤0.3% dC2 (reversed phase HPLC, DMT-dC(bz) cyanoethyl-H-posphonate)
≤0.3% dC3 (reversed phase HPLC, DMT-dC(bz) phosphoramidate)
≤0.3% dC5 (reversed phase HPLC, O3′-Benzoyl-O5′-DMT-dC(bz))
≤0.30 wt. % water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(V) -25-99ppm (31P-NMR)
≤3.0 wt. % residual solvent content

Couleur

white to off-white

Solubilité

soluble, clear

Adéquation

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

Profil des nucléosides

base: deoxycytidine
base protecting group: benzoyl
2' protecting group: none
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

Température de stockage

2-8°C

Chaîne SMILES 

COc1ccc(cc1)C(OC[C@H]2O[C@H](C[C@@H]2OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)N3C=CC(NC(=O)c4ccccc4)=NC3=O)(c5ccccc5)c6ccc(OC)cc6

InChI

1S/C46H52N5O8P/c1-32(2)51(33(3)4)60(57-29-13-27-47)59-40-30-43(50-28-26-42(49-45(50)53)48-44(52)34-14-9-7-10-15-34)58-41(40)31-56-46(35-16-11-8-12-17-35,36-18-22-38(54-5)23-19-36)37-20-24-39(55-6)25-21-37/h7-12,14-26,28,32-33,40-41,43H,13,29-31H2,1-6H3,(H,48,49,52,53)/t40-,41+,43+,60?/m0/s1

Clé InChI

PGTNFMKLGRFZDX-SALLYJDFSA-N

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Description générale

DMT-dC(bz) Pharmadite® is a Pharmadite® product line that represents a new class of standard protected DNA phosphoramidites designed with highly controlled impurity profiles and exceptional overall purity.Pharmadite phosphoramidites are characterized by their exceptional purity and well-defined impurity profile. In particular, they are essentially free fromcontaminants that interfere in coupling reactions, such as other nucleosidic or non-nucleosidic phosphoramidites (P(III)-contaminants). All remainingimpurities in Pharmadite phosphopramidites, if present, are identified, characterized, and quantified. The impact of any such defined impurities on the synthesis of oligonucleotides is well understood and has been shown to be insignificant.

Informations légales

Pharmadite is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Code de la classe de stockage

11 - Combustible Solids

Classe de danger pour l'eau (WGK)

WGK 1

Point d'éclair (°F)

Not applicable

Point d'éclair (°C)

Not applicable


Certificats d'analyse (COA)

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