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ADN COT humain

from human placenta DNA, enriched for repetitive sequences

• Synonyme(s) : ADN COT humain, ADN humain
• Code UNSPSC : 41106310

Propriétés

• Source biologique: human placenta (DNA)
• Niveau de qualité: 100
• Qualité: Molecular Biology
• Forme: solution
• Conditionnement: pkg of 500 μg
• Fabricant/nom de marque: Roche
• Concentration: 1 mg/mL
• Impuretés: HCV/HBV, none detected; HIV 1/2, none detected
• Couleur: colorless
• Solubilité: water: miscible
• Température de stockage: −20°C

Description

Description générale

La fraction COT d′ADN génomique humain est en grande partie constituée d′éléments répétitifs qui s′hybrident rapidement. Ces séquences répétitives dispersées (IRS, interspersed repetitive sequences) comme les SINE (petits éléments nucléaires intercalés, p. ex., les séquences Alu) et les LINE (longs éléments nucléaires intercalés, par exemple, les éléments L1) sont distribués dans tout le génome. L′ADN Cot humain est préparé à partir d′ADN placentaire humaine par cisaillement, dénaturation, et réhybridation dans des conditions d′enrichissement de ces éléments répétitifs.

Les éléments répétitifs (IRS) présents dans une sonde (p. ex., sondes cosmides, YAC, pour peinture chromosomique) peuvent générer des signaux d′hybridation non spécifique qui sont distribués sur l′ensemble des chromosomes ou du génome. Pour permettre l′hybridation spécifique de la sonde sur le site cible chromosomique (par exemple, des séquences en copie unique ou des répétitions à faible nombre de copies), la sonde doit être dénaturée en présence d′un excès d′ADN COT humain non marqué. Cet ADN sert comme ADN compétiteur. Au cours de l′étape suivante, avant l′hybridation, les éléments répétitifs de la sonde s′hybrident rapidement aux répétitions présentes en excès dans l′ADN COT humain, tandis que la plupart des séquences spécifiques de la sonde restent monocaténaires et peuvent donc s′hybrider à leur cible chromosomique. Cette technique est connue sous le nom d′hybridation par suppression chromosomique in situ (CISS, chromosomal in situ suppression).

Application

L′ADN COT humain est utilisé dans l′hybridation par suppression chromosomique in situ (CISS). Les sondes cosmides ou YAC contiennent des éléments répétitifs qui produisent des signaux d′hybridation monospécifiques répartis sur l′ensemble du chromosome. Pour permettre l′hybridation spécifique sur le site cible chromosomique, la sonde est dénaturée en présence d′un excès d′ADN COT humain compétiteur non marqué. L′ADN COT humain peut être utilisé pour éliminer l′hybridation non spécifique aux séquences répétitives humaines dans les analyses par puces à ADN, et dans les expériences d′hybridation sur filtres et in situfluorescentes.

Séquence

La distribution des longueurs de fragments de l′ADN COT humain observée par électrophorèse en gel d′agarose présente un maximum dans la plage de 50 à 300 nucléotides.

Forme physique

Solution à 1 mg/ml dans du Tris-HCl 10 mM et de l′EDTA 1 mM, pH 7,4.

Autres remarques

Produit destiné uniquement à la recherche en sciences de la vie. Ne pas utiliser dans des procédures de diagnostic.

Informations sur la sécurité

• Code de la classe de stockage: 12 - Non Combustible Liquids
• Classe de danger pour l'eau (WGK): nwg
• Point d'éclair (°F): No data available
• Point d'éclair (°C): No data available