Identification de têtes de série (leads)
Après identification et validation d'une protéine cible impliquée dans une maladie, un criblage de composés est effectué pour déterminer la manière dont de petites molécules interagissent avec cette protéine cible (en l'activant ou en l'inhibant) afin d'identifier des têtes de série en vue de la découverte de médicaments.
Pour accélérer la découverte de leads, et ainsi la vitesse de découverte de nouveaux médicaments, il est essentiel de disposer de technologies de criblage rapides et efficaces. Le criblage à haut débit (HTS, high throughput screening) tire parti de l'automatisation et de la robotique pour analyser rapidement de grandes banques de composés chimiques, et au final détecter les composés les plus à même de devenir des médicaments candidats. Le criblage d'une chimiothèque codée par ADN (DEL, DNA Encoded Library) permet de conjuguer en masse des composés chimiques considérés comme des petites molécules à de courts fragments d'ADN, afin de pouvoir examiner un plus grand nombre de molécules à la recherche de l'activité et de la fonctionnalité souhaitées. Dans le criblage de conformations de médicaments d'après la structure, la structure en 3D de composés est prédite à l'aide de techniques in silico, puis des banques entières sont fixées sur les sites de liaison, et les affinités stériques et électrostatiques entre lesdits composés et la protéine cible sont évaluées. Les composés donnant les meilleurs résultats progressent alors jusqu'aux tests biologiques.
La recherche en "hit to lead" (H2L, ou transition de composé actif, ou touche, à tête de série) évalue les propriétés pharmacodynamiques, physicochimiques et pharmacocinétiques de composés actifs, afin d'identifier des têtes de série qui sont alors optimisées et analysées plus avant pour devenir des candidats potentiels dans le développement d'un médicament.
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