03-310

Reactivo SHAPE in vivo para análisis de estructura de ARN celular in vivo

permits the analysis of RNA structure in living cells

• Sinónimos: SHAPE reagent
• Código UNSPSC: 12161503
• eCl@ss: 32161000
• NACRES: NA.32

Propiedades

• Nivel de calidad: 100
• formulario: liquid
• fabricante / nombre comercial: Upstate^®
• concentración: 2 M
• técnicas: activity assay: suitable (reverse transcriptase)
• Condiciones de envío: dry ice

Descripción

Descripción general

Características y ventajas

• Disolución sin ARNasa lista para usar
• Baja toxicidad que permite su uso con células vivas
• Gran permeabilidad celular para una rápida modificación del ARN
• Reacciona con todos los nucleótidos de ARN sin sesgo para cartografía se alta resolución

El reactivo SHAPE in vivo se utiliza para determinar la estructura del ARN. Este reactivo contiene una forma muy pura de imidazolida del ácido 2-metilnicotínico (NAI). Este compuesto forma aductos 2’-O en regiones monocatenarias del ARN que pueden ser detectadas por la acilación selectiva de los grupos 2’-hidroxilo y analizada por extensión del cebador (SHAPE).

A diferencia de otros reactivos utilizados para el método SHAPE, el reactivo SHAPE in vivo basado en NAI– se absorbe rápidamente en las células y está formulado para tener bajos niveles de toxicidad, por lo que resulta ideal para utilizar en células vivas. A diferencia de otros reactivos utilizados para el análisis SHAPE, el reactivo SHAPE in vivo reacciona por igual con los cuatro nucleótidos de ARN. Esta combinación de baja toxicidad, rápida absorción y ausencia de sesgo de nucleótido permite el análisis de alta resolución de la estructura del ARN en una variedad de sistemas vivos.

Plegarse en estructuras de orden superior permite a los ARN funcionar en el interior de las células vivas y formar complejos dinámicos con las proteínas efectoras. Predecir estas estructuras tridimensionales es un reto y, por lo tanto, se han desarrollado una serie de técnicas de sondeo para estudiar el plegamiento del ARN.

Compuestos como la imidazolida del ácido 2-metilnicotínico (NAI) contenidos en reactivo SHAPE in vivo dan lugar a la formación de aductos 2-O. Estos aductos se forman rápidamente en el ARN monocatenario no emparejado y mucho más despacio en el ARN con bases emparejadas (bicatenario). A continuación puede analizarse el ARN modificado por extensión del cebador. Los nucleótidos modificados no son extendidos por las ADN polimerasas dependientes del ARN, lo que permite detectar los sitios de modificación.

Componentes

Imidazolida del ácido 2-metilnicotínico (NAI) en DMSO

Calidad

La pureza del compuesto NAI se prueba mediante HPLC.

Forma física

NAI 2 M en DMSO

Vial de 0,5 ml que contiene NAI (>97 % puro) 2 M en disolución de DMSO

Almacenamiento y estabilidad

Conservar el NAI a -20°C en un congelador no frost protegido de la luz. Con el almacenamiento adecuado (protegido de la luz y evitando excesivos ciclos de congelación-descongelación) este producto es estable durante un máximo de 6 meses a partir de la fecha de recepción.

Información legal

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Cláusula de descargo de responsabilidad

Salvo que se indique lo contrario en nuestro catálogo o en otra documentación de la empresa que acompañe al producto, nuestros productos están indicados sólo para investigación y no deben utilizarse para ningún otro propósito, como, entre otros, usos comerciales no autorizados, diagnóstico in vitro, usos terapéuticos ex vivo o in vivo o cualquier tipo de consumo o aplicación en humanos o animales.

Información de seguridad

• Código de clase de almacenamiento: 10 - Combustible liquids
• Clase de riesgo para el agua (WGK): WGK 3