17-10521
EZ-Magna NuCLEAR™ RIP (vernetzt) Zellkern-RNA-Bindungsprotein-Immunpräzipitationskit
EZ-Magna Nuclear RIP (Cross-Linked) RNA-Binding Protein Immunoprecipitation Kit is designed for the analysis of chromatin associated RNA such lncRNAs, enhancer RNAs and miRNAs.
Synonym(e):
Magnetic RNA-BP Immunoprecipitation, RNA-Binding Protein Immunoprecipitation
Anmeldenzur Ansicht organisationsspezifischer und vertraglich vereinbarter Preise
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About This Item
UNSPSC-Code:
12161503
eCl@ss:
32161000
NACRES:
NA.32
Empfohlene Produkte
Qualitätsniveau
Hersteller/Markenname
Magna Nuclear RIP
Methode(n)
RIP: suitable
activity assay: suitable (protein interaction)
immunoprecipitation (IP): suitable
Versandbedingung
dry ice
Verwandte Kategorien
Allgemeine Beschreibung
Eigenschaften und Vorteile
Magna Nuclear RIP-Kits wurden speziell für die Entdeckung und Analyse von verschiedenen Chromatin-assoziierten RNA wie lange nichtkodierende RNA, Verstärker-RNA und miRNA entwickelt. Diese Chromatin-assoziierten RNA regulieren häufig die Genexpression und können mit Anwendungen wie quantitative Reverse-Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion (RT-PCR), Microarray-Analyse (RIP-Chip) und Next-Generation-Sequencing (RIP-seq) analysiert werden.
Nuclear RIP kann mit Chromatin, dessen Wechselwirkungen durch eine Formaldehydbehandlung (vernetzt) stabilisiert werden, oder Chromatin, das nicht mit einem Vernetzungsmittel behandelt wurde (nativ), durchgeführt werden. Obwohl beide Ansätze dahingehend ähnlich sind, dass sie entwickelt wurden, um Chromatin-assoziierte RNA zu gewinnen, unterscheiden sich die eingesetzten Reagenzien und Details des Protokolls sowie die Art der nachgewiesenen Wechselwirkungen in der Regel. In vernetzter Form können Komplexe mit höherer Molekülmasse in In-vivo-Konfigurationen mit möglicherweise geringeren Affinitäten eingefangen werden. Im Gegensatz dazu wird erwartet, dass natives RIP höhere Affinität und direktere Wechselwirkungen zwischen durch Protein kodierte RNA-Bindungsmotiven und Kandidaten-RNA gewinnt. Für weniger gut verstandene Proteine und Proteinkomplexe werden oft beide Herangehensweisen eingesetzt.
Das hier beschriebene Kit ist für den vernetzten Ansatz vorgesehen. Falls ein nativer Ansatz für Sie interessant ist, besuchen Sie die Produktseite für das Magna Nuclear RIP (nativ) Kit, Katalognr. 17-10522 oder für das EZ-Magna Nuclear RIP (nativ) Kit, Katalognr. 17-10523.
- Erzeugt vernetztes Chromatin, um die Analyse einer Reihe von Chromatin-assoziierten RNA zu ermöglichen
- Flexible, skalierbare Eingabeanforderungen: RNA-Gewinnung aus Millionen von Zellen oder so wenigen wie nur 5000 Zellen
- Gemisch aus magnetischen Protein-A/G-Beads, das für Puffersysteme optimiert wurde, was zu geringen Hintergründen und hohen Signal-Rausch-Verhältnissen führt
- Geeignet für Analysen mittels RT-qPCR oder RIP-seq
- Vollständiges Set aus Reagenzien und detailliertes Protokoll für einen erfolgreichen ersten Versuch
Magna Nuclear RIP-Kits wurden speziell für die Entdeckung und Analyse von verschiedenen Chromatin-assoziierten RNA wie lange nichtkodierende RNA, Verstärker-RNA und miRNA entwickelt. Diese Chromatin-assoziierten RNA regulieren häufig die Genexpression und können mit Anwendungen wie quantitative Reverse-Transkriptase-Polymerase-Kettenreaktion (RT-PCR), Microarray-Analyse (RIP-Chip) und Next-Generation-Sequencing (RIP-seq) analysiert werden.
Nuclear RIP kann mit Chromatin, dessen Wechselwirkungen durch eine Formaldehydbehandlung (vernetzt) stabilisiert werden, oder Chromatin, das nicht mit einem Vernetzungsmittel behandelt wurde (nativ), durchgeführt werden. Obwohl beide Ansätze dahingehend ähnlich sind, dass sie entwickelt wurden, um Chromatin-assoziierte RNA zu gewinnen, unterscheiden sich die eingesetzten Reagenzien und Details des Protokolls sowie die Art der nachgewiesenen Wechselwirkungen in der Regel. In vernetzter Form können Komplexe mit höherer Molekülmasse in In-vivo-Konfigurationen mit möglicherweise geringeren Affinitäten eingefangen werden. Im Gegensatz dazu wird erwartet, dass natives RIP höhere Affinität und direktere Wechselwirkungen zwischen durch Protein kodierte RNA-Bindungsmotiven und Kandidaten-RNA gewinnt. Für weniger gut verstandene Proteine und Proteinkomplexe werden oft beide Herangehensweisen eingesetzt.
Das hier beschriebene Kit ist für den vernetzten Ansatz vorgesehen. Falls ein nativer Ansatz für Sie interessant ist, besuchen Sie die Produktseite für das Magna Nuclear RIP (nativ) Kit, Katalognr. 17-10522 oder für das EZ-Magna Nuclear RIP (nativ) Kit, Katalognr. 17-10523.
Verpackung
Kit-Kapazität: 24 RNA-Bindungsprotein-Immunpräzipitationsassays mit einem vernetzten Zellkernlysat
Komponenten
10 X Glycin
10 X PBS
Zellkernisolationspuffer
RIP-vernetzter Lysepuffer
magnetische Protein-A/G-Beads
Zellkern-RIP-Verdünnungspuffer
Waschpuffer mit geringem Salzgehalt
Waschpuffer mit hohem Salzgehalt
LiCl-Waschpuffer
TE-Puffer
RIP-Elutionspuffer
10 % SDS
0,5 mol/l EDTA
DNase I (RNase-frei)
DNase I-Ergänzung
DNase I-Reaktionspuffer
Proteaseinhibitor-Cocktail III, tierfrei
RNAse-Inhibitor
Proteinase K
Kontrollantikörper und -primer
Normales Maus-IgG als Negativkontrolle-Antikörper
Anti-EZH2-Antikörper als Positivkontrolle
NEAT1 als positive Kontrollprimer
U1-snRNA als negative Kontrollprimer
10 X PBS
Zellkernisolationspuffer
RIP-vernetzter Lysepuffer
magnetische Protein-A/G-Beads
Zellkern-RIP-Verdünnungspuffer
Waschpuffer mit geringem Salzgehalt
Waschpuffer mit hohem Salzgehalt
LiCl-Waschpuffer
TE-Puffer
RIP-Elutionspuffer
10 % SDS
0,5 mol/l EDTA
DNase I (RNase-frei)
DNase I-Ergänzung
DNase I-Reaktionspuffer
Proteaseinhibitor-Cocktail III, tierfrei
RNAse-Inhibitor
Proteinase K
Kontrollantikörper und -primer
Normales Maus-IgG als Negativkontrolle-Antikörper
Anti-EZH2-Antikörper als Positivkontrolle
NEAT1 als positive Kontrollprimer
U1-snRNA als negative Kontrollprimer
Physikalische Form
Zwei Packungen mit Schlüsselreagenzien zum Erzeugen von vernetzten Zellkernlysaten und Durchführen von 24 einzelnen RNA-Bindungsprotein-Immunpräzipitations(RIP)-Reaktionen. Zusätzlich eine Packung mit Positiv- und Negativkontrolle-Antikörpern und qPCR-Primern.
Lagerung und Haltbarkeit
Komponenten nach Erhalt bei den auf den Etiketten angegebenen Temperaturen aufbewahren.
Bei Lagerung nach Anweisung sind die Kit-Komponenten ab Versanddatum 6 Monate stabil.
Bei Lagerung nach Anweisung sind die Kit-Komponenten ab Versanddatum 6 Monate stabil.
Rechtliche Hinweise
NuCLEAR is a trademark of Sigma-Aldrich Co. LLC
Signalwort
Danger
H-Sätze
Gefahreneinstufungen
Aquatic Acute 1 - Aquatic Chronic 2 - Eye Dam. 1 - Skin Irrit. 2
Lagerklassenschlüssel
10-13 - German Storage Class 10 to 13
WGK
WGK 3
Analysenzertifikate (COA)
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