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17-10495

Sigma-Aldrich

EZ-Magna ChIRP®-RNA-Interaktom-Kit

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About This Item

UNSPSC-Code:
41105331
NACRES:
NA.84

Qualitätsniveau

Allgemeine Beschreibung

Das Magna ChIRP-RNA-Interaktom-Kit verwendet das ChIRP-Verfahren (Chromatin Isolation by RNA Purification), um die Identifikation und Analyse von Chromatinregionen zu ermöglichen, die mit einer bestimmten Chromatin-assoziierten RNA interagieren. Diese neuartige Anti-Sense-Einfangstrategie auf Sondenbasis verwendet vernetztes Chromatin, um eine nicht verzerrte Entdeckung von RNA-assoziierten DNA-Sequenzen und Proteinen zu ermöglichen. Zur Durchführung von ChIRP werden zwei Pools aus mehreren biotinylierten Oligonukleotidsonden eingesetzt, die zu der RNA von Interesse komplementär sind (siehe Abbildung 1). Diese Sondensets werden mit Chromatin kombiniert und zu Chromatin-assoziierter RNA hybridisiert. Komplexe, die biotinylierte, an die die Chromatin-assoziierte RNA gebundene Sonden enthalten, werden anschließend mit magnetischen Streptavidin-Beads isoliert. DNA oder RNA kann anschließend gewonnen und durch quantitative PCR oder Next-Generation-Sequenzing (ChIRP-seq) analysiert werden. Alternativ kann eine Proteomikanalyse des rückgewonnenen Chromatins durchgeführt werden.

Anwendung

Das EZ-Magna ChIRP-RNA-Interaktom-Kit ermöglicht die Analyse und Kartierung von Chromatinregionen, die mit Chromatin-assoziierten RNA interagieren. Basierend auf dem ChIRP-Verfahren (chromatin isolation by RNA purification) ermöglicht dieser sondenbasierte Einfang-Assay die Entdeckung von RNA-assoziierten DNA-Sequenzen und Proteinen.

Verpackung

Kit-Kapazität: 12 Chromatinisolationen durch RNA-Aufreinigungs-Assays (einschließlich Negativkontrolle-Sonden, gerade und ungerade Positivkontrolle-TERC-IncRNA-Sonden sowie Kontroll-PCR-Primer-Sets)

Komponenten

10X-Glycin, Lysepuffer, Hybridisierungspuffer (ohne 15 % Formamid), Waschpuffer, Proteinase K-Puffer (für DNA), Proteinase K-Puffer (für RNA), DNA-Elutionspuffer, 0,5 mol/l EDTA, magnetische Streptavidin-Beads, RNase-Inhibitor, Protease-Inhibitor-Cocktail III, Proteinase K-Lösung, RNase-freie DNase I, DNase I-Reaktionspuffer, RNase A (20 mg/ml), RNase H (10 E/μl), Magna ChIRP-Negativkontrolle-Sondenset (LacZ), Magna ChIRP TERC lncRNA-Sonden-Set (gerade), Magna ChIRP TERC lncRNA-Sondenset (ungerade), RNA-Positivkontrolle-Primer (TERC-Gen), RNA-Positivkontrolle-Primer (GAPDH-Gen), Magna ChIRP-Primer, WNT-1-Vorläufer, ChIP-Primer, D2 kodierendes GAPDH

Rechtliche Hinweise

MAGNA CHIRP is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Haftungsausschluss

Sofern in unserem Katalog oder anderen Begleitdokumenten unserer Produkte nicht anders angegeben, sind unsere Produkte nur für Forschungszwecke vorgesehen und nicht für andere Zwecke zu verwenden, einschließlich, jedoch nicht beschränkt auf unautorisierte kommerzielle Verwendung, zur In-vitro-Diagnostik, für Ex-vivo- oder In-vivo-Therapiezwecke oder jegliche Art der Einnahme oder Anwendung bei Menschen oder Tieren.

Piktogramme

Health hazard

Signalwort

Danger

H-Sätze

Gefahreneinstufungen

Eye Irrit. 2 - Resp. Sens. 1

Lagerklassenschlüssel

10 - Combustible liquids

WGK

WGK 3


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