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  • Quantitative Yeast Genetic Interaction Profiling of Bacterial Effector Proteins Uncovers a Role for the Human Retromer in Salmonella Infection.

Quantitative Yeast Genetic Interaction Profiling of Bacterial Effector Proteins Uncovers a Role for the Human Retromer in Salmonella Infection.

Cell systems (2018-08-06)
Kristin L Patrick, Jason A Wojcechowskyj, Samantha L Bell, Morgan N Riba, Tao Jing, Sara Talmage, Pengbiao Xu, Ana L Cabello, Jiewei Xu, Michael Shales, David Jimenez-Morales, Thomas A Ficht, Paul de Figueiredo, James E Samuel, Pingwei Li, Nevan J Krogan, Robert O Watson
RÉSUMÉ

Intracellular bacterial pathogens secrete a repertoire of effector proteins into host cells that are required to hijack cellular pathways and cause disease. Despite decades of research, the molecular functions of most bacterial effectors remain unclear. To address this gap, we generated quantitative genetic interaction profiles between 36 validated and putative effectors from three evolutionarily divergent human bacterial pathogens and 4,190 yeast deletion strains. Correlating effector-generated profiles with those of yeast mutants, we recapitulated known biology for several effectors with remarkable specificity and predicted previously unknown functions for others. Biochemical and functional validation in human cells revealed a role for an uncharacterized component of the Salmonella SPI-2 translocon, SseC, in regulating maintenance of the Salmonella vacuole through interactions with components of the host retromer complex. These results exhibit the power of genetic interaction profiling to discover and dissect complex biology at the host-pathogen interface.

MATÉRIAUX
Référence du produit
Marque
Description du produit

Sigma-Aldrich
Glycine, ReagentPlus®, ≥99% (HPLC)
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Quantité
Sigma-Aldrich
Anticorps monoclonal ANTI-FLAG® M2 antibody produced in mouse, clone M2, purified immunoglobulin (Purified IgG1 subclass), buffered aqueous solution (10 mM sodium phosphate, 150 mM NaCl, pH 7.4, containing 0.02% sodium azide)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Peptide 3X FLAG®, lyophilized powder
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Acide L-aspartique, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
D-(+)-Raffinose pentahydrate, ≥98.0% (HPLC)
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Prix
Quantité
Millipore
Gel d'affinité ANTI-FLAG® M2 EZview Rouge, clone M2
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Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Nourseothricin sulfate, ≥85% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
DL-Cysteine, technical grade
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Tryptophane, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Proline, ReagentPlus®, ≥99% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Isoleucine, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Méthionine, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Tyrosine, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Threonine, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
L-Valine, reagent grade, ≥98% (HPLC)
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Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité
Sigma-Aldrich
Suplatast tosylate, ≥98% (HPLC)
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Conditionnement
Disponibilité
Prix
Quantité