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Analyses cliniques et médicolégales

Tube à essai placé dans une enveloppe postale

Les analyses cliniques sont une source cruciale d'informations essentielles qui influent sur les décisions prises en matière de santé humaine. Les principaux types de tests diagnostiques utilisés par les laboratoires d'analyse clinique sont soit des tests de diagnostic in vitro (IVD), soit des tests développés en laboratoire (LDT pour "lab developed test"). Ces tests examinent un vaste éventail d'analytes issus de divers types d'échantillons pour fournir d'importantes informations diagnostiques. Les laboratoires cliniques assurent également le criblage des médicaments, le suivi thérapeutique pharmacologique et l'identification des drogues. L'analyse médicolégale vient généralement en soutien du système judiciaire dans le cadre d'enquêtes et autres procédures juridiques.

Les principales solutions d'analyse proposées sont les immunoessais tels que les tests ELISA et l'immunohistochimie (IHC), les techniques de diagnostic moléculaire comme la PCR, la qPCR et le séquençage, et les techniques de chimie analytique, notamment la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS).


Articles techniques apparentés

Protocoles apparentés


Rôle des tests développés en laboratoire (LDT) dans l'analyse de diagnostic clinique en laboratoire

Scientifique examinant un tube à essai au laboratoire

Les LDT sont une solution d'analyse essentielle du laboratoire clinique, même s'ils ne représentent généralement qu'une petite partie de son activité. Ils viennent en complément des nombreux tests de diagnostic in vitro (IVD) proposés.

Les LDT répondent typiquement aux besoins du marché de l'analyse clinique qui ne peuvent être couverts par les tests IVD actuellement disponibles, ou bien offrent une valeur ajoutée par rapport à leurs équivalents IVD. Dans certains cas, ils répondent aux besoins d'analyse ésotériques des pathologies rares pour lesquelles le développement commercial de tests IVD n'est pas justifié. Dans d'autres cas, les LDT constituent une réponse rapide aux maladies infectieuses émergentes, comme ce fut le cas avec la pandémie de SARS-CoV-2 (COVID-19).

L'une des différences notables entre le LDT et le test IVD est la responsabilité que le laboratoire prend dans le développement et la gestion de ces LDT, qui lui donnent la flexibilité et l'agilité nécessaires pour répondre aux besoins pour lesquels il n'existe à l'heure actuelle aucune solution satisfaisante.

Tests développés en laboratoire (LDT) - analyses courantes et types d'échantillon

Prise de sang en milieu clinique

Les LDT peuvent s'appuyer sur un vaste choix de solutions d'analyse, mais les principaux reposent sur : la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS), les techniques de diagnostic moléculaire (MDx) telles que la PCR quantitative (qPCR) et le séquençage de nouvelle génération (NGS), et les approches du type immunoessai (IA) comme les tests ELISA (essais immuno-enzymatiques).

Chez l'homme, les analyses courantes sont généralement pratiquées sur le sang et l'urine pour les tests de routine, et sur les cheveux, les poils ou la salive dans certains cas particuliers comme le dépistage de drogues.

Suivi thérapeutique pharmacologique

Tubes à essai avec bouchon violet contenant de la ciclosporine

Le suivi thérapeutique pharmacologique joue un rôle important dans le cadre des programmes de traitement critiques, en permettant de contrôler l'observance et/ou de garantir la sécurité des patients. Par exemple, ce suivi peut servir à s'assurer que les concentrations du médicament administré dans le cadre d'un traitement sont efficaces et sans danger. Voici quelques exemples de médicaments pouvant faire l'objet d'un suivi :

  • Antibiotiques
  • Médicaments destinés aux problèmes cardiaques
  • Médicaments anti-épileptiques
  • Médicaments destinés aux maladies auto-immunes
  • Médicaments destinés aux troubles bipolaires

Un suivi thérapeutique pharmacologique est inclus dans les approches cliniques de la gestion de la douleur chez les patients, pour vérifier l'observance du programme de traitement et limiter le risque d'abus de certains médicaments, comme les opioïdes.

Dépistage de drogues – types d'échantillon/de test et solutions d'analyse

Échantillon de cocaïne dans un tube à essai

Le dépistage de drogues identifie la présence de drogues illicites ou le détournement de médicaments sur ordonnance pour des raisons légales, pour assurer la sécurité des patients et/ou dans le cadre d'un contrat de travail. Les drogues et médicaments typiquement recherchés sont les suivants :

  • Amphétamines : méthamphétamine, amphétamine
  • Barbituriques : phénobarbital, sécobarbital, pentobarbital, butalbital, amobarbital
  • Benzodiazépines : diazépam, lorazépam, oxazépam, témazépam, alprazolam
  • Cannabinoïdes : marijuana
  • Cocaïne : cocaïne et/ou son métabolite (benzoylecgonine)
  • Méthadone : méthadone, métabolite de la méthadone (EDDP)
  • Opiacés : codéine, morphine, métabolite de l'héroïne, oxycodone, oxymorphone, hydrocodone, hydromorphone
  • Phéncyclidine : PCP

Une approche typique peut consister en un test de dépistage urinaire associé à un test sanguin de confirmation.

Toxicologie – applications en analyse clinique et en médecine légale

Outils de recueil de preuves médicolégales

La toxicologie englobe le suivi thérapeutique pharmacologique et les analyses de dépistage de drogues dans les laboratoires cliniques, ainsi que l'analyse des échantillons prélevés sur les scènes de crime et le travail d'enquête des laboratoires de médecine légale. Les types d'échantillon analysés dans un cadre médico-légal proviennent de sources plus variées, mais nombre des techniques analytiques mises en œuvre en aval sont similaires et dépendent avant tout des analytes recherchés.

Principaux usages, matériel et étapes de l'analyse par LC-MS

Plaque d'échantillons pour analyse par LC-MS

L'analyse par LC-MS débute avec le prélèvement de l'échantillon et peut comprendre une étape de préparation de l'échantillon avant la séparation, la détection et la quantification. La préparation de l'échantillon peut impliquer des traitements enzymatiques, un lavage de l'échantillon par filtration, un enrichissement ou d'autres étapes de purification. La séparation de l'échantillon intervient durant les étapes de chromatographie en phase liquide (LC), suite à quoi l'analyte est détecté et quantifié par spectrométrie de masse (MS). L'étalonnage de l'instrument et le référencement de l'analyte par comparaison avec des étalons adaptés constituent une partie cruciale de ce processus. Les matériaux de référence certifiés et les étalons analytiques jouent un rôle essentiel dans une analyse par LC-MS.

L'analyse par LC-MS est fréquemment employée pour diverses raisons, notamment :

  • Suivi thérapeutique pharmacologique
  • Dépistage de drogues
  • Analyse métabolique
  • Contrôle hormonal
  • Contrôle des vitamines
  • Dépistage néonatal

Exemples de matériel utilisé à chaque étape :

  • Prélèvement et préparation des échantillons
    • Dispositifs de filtration
    • Flacons d'analyse
    • Enzymes – Bêta-glucuronidase
    • Pointes, plaques et colonnes d'extraction en phase solide (SPE)
    • Pointes, plaques et colonnes de microextraction en phase solide (SPME)
  • Séparation des échantillons
    • Colonnes et accessoires de HPLC
    • Solvants de HPLC
    • Réactifs de chromatographie
  • Détection et quantification des échantillons
    • Matériaux de référence certifiés
    • Étalons analytiques

Principaux usages, matériel et étapes de l'analyse par PCR

Échantillon de sang pour le dépistage du SARS-CoV-2 dans un tube à essai

L'analyse par PCR débute avec le prélèvement de l'échantillon et peut comprendre une étape de purification suivie d'une étape d'amplification spécifique d'un ADN/ARN cible. Dans le cas de la qPCR, la quantification se fait en temps réel durant les cycles d'amplification. La qPCR est parfois appelée RT-PCR de par son déroulement en temps réel (RT en anglais). Une autre solution est la PCR en point final, où les résultats sont déterminés après les cycles d'amplification.

L'analyse par PCR est indiquée dans toutes les situations nécessitant de connaître la présence, la longueur ou la séquence d'un ADN ou d'un ARN. Il peut s'agir par exemple des cas suivants :

  • Dépistage et identification de maladies infectieuses
  • Dépistage génétique
  • Oncologie
  • Dépistage prénatal

Matériel de PCR :

  • Purification des échantillons
    • Kits et réactifs de purification d'acides nucléiques (NAP)
  • Amplification des échantillons
    • Oligonucléotides, amorces, sondes
    • Enzymes d'amplification de l'ADN (Taq par exemple)
    • Enzymes de transcription inverse (RT)
    • Réactifs d'amplification par PCR, notamment tampons, sels et nucléotides (dNTP)

Principaux usages, matériel et étapes des tests ELISA

Scientifique examinant une plaque de microtitration ELISA

Le test ELISA (essai immuno-enzymatique) est une technique d'immuno-essai très répandue qui permet de cribler et de quantifier à haut débit des anticorps, des protéines, des peptides et d'autres petites molécules.

Le test ELISA peut convenir à un vaste éventail d'applications d'analyse, notamment :

  • Oncologie
  • Maladies infectieuses
  • Dépistage de drogues
  • Quantification d'hormones
  • Fonction immunitaire / immunologie

Les test ELISA se font généralement sur une plaque, le format à 96 puits étant le plus courant. Ces plaques peuvent être fournies prêtes à l'emploi (IVD) ou développées en interne (LDT). Produits couramment utilisés pour créer une plaque ELISA du type sandwich :

  • Plaque ELISA
  • Anticorps de capture
  • Réactifs d'enrobage, par ex. BSA, caséine, etc.
  • Tampons de lavage

Matériel typiquement utilisé après préparation de la plaque :

  • Préparation des échantillons
    • Réactifs de lyse
    • Tampons
    • Détergents
    • Inhibiteurs de protéases
  • Fixation/lavage des échantillons
    • Tampons, par ex. PBS, PBS-T
  • Détection
    • Anticorps de détection primaires, spécifiques à l'analyte recherché
    • Anticorps marqués/conjugués secondaires, par ex. marqués à la phosphatase alcaline (PAL ou ALP) ou à la peroxydase de raifort (HRP)
    • Réactifs de détection d'anticorps marqués, par ex. TMB, OPD, pNPP et peroxyde d'hydrogène
    • Réactif d'arrêt

Déroulement d'une analyse par LC-MS

Sample Collection

Prélèvement des échantillons

Le prélèvement et la préparation des échantillons sont des phases essentielles au début de l'analyse par LC-MS. Ces étapes servent à garantir l'intégrité des échantillons et à les traiter de manière appropriée pour pouvoir les utiliser dans les étapes suivantes de l'analyse.

    Sample Preparation
    Standardization and Calibration
    Chromatographic Separation and Analysis

    Les colonnes, les solvants, les réactifs et les accessoires ont un effet crucial sur l'exactitude, la fiabilité et l'efficacité de votre analyse. Vous pouvez exploiter les ressources techniques à votre disposition pour optimiser votre approche.





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