Ganzgenom-Amplifikation

Zugehörige Produktressourcen

Kits für die Ganzgenom-Amplifikation (WGA)

Genomische Tests und Charakterisierung sind zu einem wichtigen Instrument für das Verstehen biologischer Systeme geworden. Häufig wird eine solche Analyse durch die Anzahl der zu untersuchenden Proben und die Verfügbarkeit ausreichender Mengen genomischer DNA erschwert. Dies stellt insbesondere ein Problem bei seltenen und archivierten DNA-Quellen dar. Die GenomePlex^® Kits für die Ganzgenom-Amplifikation (WGA) wurden für den Einsatz als Hochdurchsatzsystem für die schnelle und hochrepräsentative Amplifikation genomischer DNA aus Spurenmengen von Ausgangsmaterial entwickelt.

In GenomePlex^® WGA-Kits wird eine proprietäre Amplifikationstechnologie eingesetzt, die auf der Zufallsfragmentierung genomischer DNA und der Umwandlung der resultierenden kleinen Fragmente in PCR-amplifizierbare OmniPlex^® Molekülbibliotheken, flankiert von universellen Primeranlagerungsstellen, basiert. Die OmniPlex^® Bibliothek wird dann unter Verwendung universeller Oligonukleotid-Primer und einer begrenzten Anzahl von Zyklen amplifiziert. GenomePlex^® WGA-Kits benötigen Nanogrammmengen genomischer DNA mit Ausbeuten von 5-10 µg im Anschluss an die PCR. Dieses System eignet sich für eine Vielzahl aufgereinigter DNA-Proben, darunter Vollblut, Blutkarten, Wangenabstriche, pflanzliche Quellen und formalinfixierte, Paraffin-eingebettete Gewebeproben.

Strategien zur Ganzgenom-Amplifikation einzelner Zellen

Das GenomePlex^® Kit für die Ganzgenom-Amplifikation einzelner Zellen (WGA4) wurde entwickelt, um das Genom einer einzelnen Zelle zu amplifizieren, was zu einer millionenfachen Amplifikation führt und in Mikrogrammmengen genomischer DNA resultiert. Durch die Anwendung traditioneller Methoden zur Ganzgenom-Amplifikation einzelner Zellen werden nur unzureichende Mengen mit signifikant verzerrter Darstellung erzielt. Die GenomePlex^® Technologie bietet jedoch Amplifikationseffizienz mit WGA-DNA-Polymerase. Das WGA-Kit für einzelne Zellen enthält alle Reagenzien, die für die Zelllyse und die anschließende Ganzgenom-Amplifikation erforderlich sind.

Das WGA-Kit für einzelne Zellen wurde mit zahlreichen Downstream-Anwendungen validiert und eignet sich für die Amplifikation aus einer Vielzahl Quellen, darunter Pflanzen, Polycarbonat-fixierte Zellen, Lymphozyten, Nierenkrebszellen, Epithelzellen, Leukämiezellen und amniotische Fibroblasten. Das amplifizierte Genom ist mit vielen Downstream-Anwendungen kompatibel, darunter vergleichende genomische Hybridisierung (CGH), Mikrosatelliten-/STR-Analyse, SNP-Analyse, QPCR und andere Genotypisierungsanalysen.

Amplifikation des Ganztranskriptoms

Es werden Kits für die Amplifikation des Ganztranskriptoms (WTA) entwickelt, um aus winzigen RNA-Mengen ausreichende Transkript-Ziele zu erzeugen. Eine erfolgreiche WTA erfordert eine genaue Replikation der in einer Probe vorhandenen repräsentativen Transkripte - ohne Ausfälle oder Verzerrungen bei spezifischen mRNA. Unsere WTA-Kits bieten eine genaue, schnelle und einfache Methode zur Amplifikation von Gesamt-RNA aus einer Vielzahl von Quellen wie Blut, fixiertem und gefrorenem Gewebe, Zellkulturen, FACS-sortierten Zellen, Pflanzen und Mikroorganismen. Darüber hinaus ermöglichen die WTA-Kits (WTA1, WTA2, SeqR) eine schnelle Amplifikation von Gesamt-RNA in weniger als 4 Stunden ohne 3'-Bias. Amplifizierte RNA (cDNA) eignet sich für qPCR, Microarray-Analysen und traditionelles Klonen. Weitere Informationen erhalten Sie auf unseren Produktseiten zu WTA1, WTA2 oder SeqR.

SeqPlex-I DNA- und RNA-Amplifikations-Kits für Illumina^® Next Generation Sequencing

Die SeqPlex-I DNA- und RNA-Amplifikations-Kits für die Ganzgenom-Amplifikation (WGA) und die Amplifikation des Ganztranskriptoms (WTA) wurden entwickelt, um das Illumina^® Next Generation Sequencing (NGS) aus extrem kleinen Mengen oder degradierter/hoch fragmentierter DNA und RNA zu erleichtern. Sowohl in den WGA- als auch in den WTA-Kits wird eine proprietäre Technologie eingesetzt, die auf dem Zufalls-Priming genomischer DNA oder RNA und der Umwandlung der resultierenden kleinen Fragmente in PCR-amplifizierbare Molekülbibliotheken, flankiert von universellen Primeranlagerungsstellen, basiert. Die SeqPlex-I WGA- und WTA-Kits ermöglichen die einfache Amplifikation begrenzter Ausgangsproben für die bequeme direkte Eingabe in Illumina^® NGS-Durchflusszellen, wodurch Sie den Weg zu Ihrer nächsten bahnbrechenden Entdeckung verkürzen können.