NGS 라이브러리 제조

관련 제품 자료

유전체 DNA 추출 키트

DNA 라이브러리 전처리를 위해 고분자량 유전체 DNA(gDNA)를 세포, 조직 또는 기타 시료 유형에서 추출해야 합니다. 정제된 유전체 DNA는 후속 증폭 또는 서열분석 반응에서 최적의 성능을 위해 최소한의 전단 그리고 생물학적 및 화학적 오염 물질이 있어야 합니다.  

Fire Monkey™/Fire Flower™ 고분자량 DNA 추출 키트를 사용하여 최소한의 전단과 저분자량 핵산 오염 물질로 고순도 유전체 DNA를 분리할 수 있습니다.

• Fire Monkey™는 박테리아 또는 포유류 세포에서 평균 가닥 길이가 >100kb인 고분자량 DNA를 1시간 내에 추출하는 표준 스핀 컬럼 공정입니다.
• Fire Flower™는 15분 이내에 모든 샘플 소스로부터 추출된 DNA를 크기 선택할 수 있는 표준 스핀 컬럼 프로세스입니다. Fire Flower™는 DNA 절편을 최대 30kb까지 고갈시키면서 전체 평균 가닥 길이를 30% 증가할 수 있습니다. 

전장 유전체 증폭 키트

DNA 서열분석은 소량의 사용 가능한 시료 또는 낮은 추출 수율 때문에 제한되는 경우가 빈번합니다. 제한된 출발 물질을 얻을 수 있는 경우 출발 DNA의 양을 증량하도록 증폭 기술을 사용할 수 있습니다. 전장 유전체 증폭(WGA)을 사용하여 NGS 작업공정에 투입하도록 무손상 DNA 시료 및 고도로 절편화된 DNA 시료 모두를 사전 증폭할 수 있습니다.

SeqPlex-I WGA 키트를 사용하여 Illumina® 차세대 서열분석(NGS) 플로우 셀에 직접 투입하기 위해 소량의 DNA 또는 분해되거나 고도로 절편화된 DNA를 증폭할 수 있습니다.  

• 최소 100pg의 DNA로부터 서열분석을 촉진함
• 차세대 서열분석(NGS)에 이상적인 완전 게놈 적용 범위, 최소한의 시퀀스 바이어스(bias) 및 앰플리콘 크기를 위한 향상된 프라이머
• 비용 효율성: 추가적인 NGS 라이브러리 전처리 단계가 없음
• Illumina^® 차세대 서열분석과 호환됨

전장 유전체 증폭용 SeqPlex Enhanced DNA Amplification Kit는 극소량 또는 분해/고도로 절편화된 DNA에서 차세대 서열분석을 촉진하도록 설계되었습니다. 이러한 키트는 Illumina^®, SOLiD™ 또는 454 서열분석 작업공정에 통합되도록 개발되었습니다.

• ChIP 또는 FFPE와 같은 절편화된 DNA를 증폭하는 무작위 프라이밍 기술
• 최소 100pg의 ChIP DNA로부터 서열분석을 촉진함
• 완전 게놈 적용 범위, 최소한의 서열 바이어스(bias) 및 프라미어 제거를 위한 향상된 프라이머
• 차세대 서열분석을 위해 Illumina^®, SOLiD™ 또는 454 라이브러리 전처리와 호환됨

전장 전사체 증폭 키트

RNA-Seq용 NGS 라이브러리를 준비하는 주요 목표는 바이어스(bias)를 줄이면서 시작 서열 풀(pool)을 완전히 나타내도록 전사체 라이브러리 복잡성을 최대화하는 것입니다. 고처리량 유전자 발현 프로파일링 및 전사체 분석을 위한 RNA-Seq는 소량의 시작 RNA로 인해 어려움이 발생합니다. 전장 전사체 증폭(WTA)을 사용하여 소량의 RNA로부터 충분한 양의 서열분석 표적을 생성할 수 있지만 라이브러리 바이어스(bias)를 줄이도록 특정 mRNA의 손실이나 왜곡 없는 충실도가 높은 전사 복제가 필요합니다.

SeqPlex-I WTA 키트를 사용하여 Illumina® 차세대 서열분석(NGS) 플로우 셀에 직접 투입하기 위해 소량의 역전사 RNA 또는 분해된 RNA를 증폭할 수 있습니다. 

• 절편화되거나 극소량의 총 RNA를 증폭합니다. 무작위 프라이밍 기술을 사용하여 FFPE 및 RIP를 포함한 모든 공급원의 절편화되거나 무손상 RNA를 쉽게 증폭할 수 있습니다.
• 보다 완전한 전사체 적용 범위와 효율적인 프라이밍을 보장하는 반축퇴(semi-degenerate) 라이브러리 프라이머 디자인
• 간소한 단계: 서열분석 이전에 cDNA를 절편화할 필요가 없음
• 고효율성: 8시간 미만에 ds-cDNA 증폭
• 비용 효율성: 추가적인 NGS 라이브러리 전처리 단계가 더 이상 필요 없음
• Illumina^® 차세대 서열분석과 호환됨

전장 전사체 증폭(WTA)용 SeqPlex RNA 증폭 키트는 소량 또는 분해/고도로 절편화된 RNA(예: 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 시료의 RNA)로부터 차세대 서열분석(NGS)을 촉진하도록 설계되었습니다. SeqPlex 키트를 사용하여 NGS 작업공정에 투입하도록 RNA 시료를 사전 증폭할 수 있습니다.

• 무작위 프라이밍 기술은 FFPE 및 RIP를 포함한 모든 공급원으로부터 소량의 절편화되거나 무손상 RNA를 증폭합니다.
• 보다 완전한 전사체 적용 범위와 효율적인 프라이밍을 위한 반축퇴(semi-degenerate) 라이브러리 프라이머 디자인.
• 서열분석 이전에 DNA를 단편화할 필요가 없음.
• 8시간 미만에 ds-cDNA 증폭.
• Pacific Bioscience를 제외한 모든 차세대 서열분석과 호환됨.

소형 RNA 라이브러리 전처리

NGS 기술은 유전자 발현의 번역 후 조절에 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀진 miRNA, siRNA, piRNA를 포함한 소형 RNA 연구에 혁명을 일으켰습니다. 소형 RNA 서열분석은 소형 RNA 발견 및 프로파일링에서 점점 인기를 얻고 있는 접근 방식입니다. 그러나 소형 RNA 라이브러리 전처리 방법은 특히 어댑터 결찰 단계에서 상당한 바이어스(bias)를 도입할 수 있습니다. 

RealSeq^®-AC RNA 라이브러리 전처리 키트는 miRNA 및 소형 RNA 시퀀싱 라이브러리를 준비하는 새로운 방법을 제공하여 NGS에서의 포함 바이어스(bias)를 감소시킵니다. 새로운 단일 어댑터와 원형화(circularization)를 이용하여, RealSeq^®는 라이브러리 전처리 바이어스(bias)를 크게 감소시킵니다. 이 기술은 많은 miRNA들이 저탐지되는 일반적으로 사용되는 시퀀싱 라이브러리 준비의 문제를 해결합니다.

• 소형 RNA 서열분석에서 서열분석 바이어스(bias)를 크게 감소함
• 생물학적으로 관련된 소형 RNA를 정확하게 정량화
• 신규 소형 RNA를 보다 효율적으로 발견하도록 허용함

라이브러리 정화

NGS 라이브러리 정화는 서열분석 어댑터, PCR 프라이머, dNTP, 효소 및 버퍼 오염 물질을 제거하는 동시에 다운스트림 서열분석을 위해 올바른 크기 범위에 있는 핵산의 선택을 가능하게 합니다. 라이브러리 정화 방법은 수율과 회수율을 최대화해야 하고, 생물학적 및 화학적 오염 물질의 존재를 최소화해야 하며, 서열분석 전처리에서 원하지 않는 핵산 절편 또는 라이브러리 분자를 제거해야 합니다.

HighPrep™ PCR Clean-up System은 파라마그네틱 비드를 기반으로 한 PCR 후 정제 시약으로, DNA 조각의 효율적인 정제와 앰플리콘의 크기별 선택을 위해 설계되었습니다. 이 정제 과정은 염분, 프라이머, 프라이머-다이머, dNTPs를 제거하며, DNA 조각은 자성 비드 입자에 선택적으로 결합됩니다. 자성 비드는 NGS에 대한 다양한 라이브러리 전처리 화학물질에 사용됩니다.

• >100bp 앰플리콘의 높은 회수율
• 높은 처리량의 액체 취급 시스템에 적용 가능
• 앰플리콘 > 100bp의 안정적인 복구, 예측 가능하고 일관된 크기 선택
• 원심분리 또는 여과 없이도 더 높고 순수한 수율 획득