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Merck

A211150

Sigma-Aldrich

DMT-2′O-Methyl-rA(bz) Phosphoramidite

configured for (ÄKTA® and OligoPilot®), configured for ABI

Sinónimos:

DMT-2′-O-Me-rA(bz) amidite, N-benzoyl-5′-O-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2′-O-methyl-adenosine, 3′-[2-cyanoethyl N,N-bis(1-methylethyl)phosphoramidite]

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About This Item

Fórmula empírica (notación de Hill):
C48H54N7O8P
Número de CAS:
Peso molecular:
887.96
Número MDL:
Código UNSPSC:
41116105
ID de la sustancia en PubChem:
NACRES:
NA.51

origen biológico

non-animal source (no BSE/TSE risk)

Nivel de calidad

Línea del producto

Proligo Reagents

Análisis

≥99% (31P-NMR)
≥99.0% (reversed phase HPLC)

formulario

powder

técnicas

oligo synthesis: suitable

impurezas

≤0.1% single unspecified Impurity (reversed phase HPLC)
≤0.3% mA2 (reversed phase HPLC, Hydrolysate)
≤0.3% mA3 (reversed phase HPLC, DMT-rA(bz)me)
≤0.3% water content (Karl Fischer)
≤0.5% P(III) Impurities 100-169ppm (31P-NMR)
≤1.0% mA1 (reversed phase HPLC, DMT-rA(bz)me-DMT)
≤3% residual Solvent content

color

white to off-white

λ

conforms (UV/VIS Identity)

idoneidad

conforms to structure for H-NMR
conforms to structure for LC-MS

compatibilidad

configured for (ÄKTA® and OligoPilot®)
configured for ABI

perfil del nucleósido

base: adenosine
base protecting group: benzoyl
2' protecting group: methyl
5' protecting group: DMT
deprotection: standard

temp. de almacenamiento

2-8°C

cadena SMILES

CO[C@@H]1[C@H](OP(OCCC#N)N(C(C)C)C(C)C)[C@@H](COC(c2ccccc2)(c3ccc(OC)cc3)c4ccc(OC)cc4)O[C@H]1n5cnc6c(NC(=O)c7ccccc7)ncnc56

InChI

1S/C48H54N7O8P/c1-32(2)55(33(3)4)64(61-28-14-27-49)63-42-40(62-47(43(42)59-7)54-31-52-41-44(50-30-51-45(41)54)53-46(56)34-15-10-8-11-16-34)29-60-48(35-17-12-9-13-18-35,36-19-23-38(57-5)24-20-36)37-21-25-39(58-6)26-22-37/h8-13,15-26,30-33,40,42-43,47H,14,28-29H2,1-7H3,(H,50,51,53,56)/t40-,42-,43-,47-,64?/m1/s1

Clave InChI

AZCGOTUYEPXHMJ-PSVHYZMASA-N

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Descripción general

DMT-2′O-Methyl-rA(bz) Phosphoramidite is a 2′O-Methyl RNA monomer that is compatible with fast deprotection schemes that are based on the application of aliphatic amines, such as methylamine. Modern phosphoramidite-mediated synthesis has enabled routine high-yielding preparations of 2′O-Methyl RNA oligonucleotides. High-quality RNA phosphoramidites are key to low failure rates, the high biological activity of synthesis products, and cost-effectiveness. 2′O-Methyl RNA is a nucleic acid analog that is characterized by the exceptional hybridization properties that it imparts with complementary DNA or RNA, as well as increased stability against enzymatic degradation compared to natural nucleic acids.

Aplicación

2′O-Methyl RNA nucleoside including DMT-2′O-Methyl-rA(bz) Phosphoramidite can be advantageously incorporated in nucleic acid probes with RNA or DNA for in-vivo or in-vitro applications to convey nuclease resistance.The unique combination of properties of 2′O-Methyl RNA had found widespread use in the fields of:
  • Diagnostic probes
  • Aptamer and ribozyme development
  • Mixed 2′O-Methyl-RNA/DNA antisense molecules (a)

Información legal

OligoPilot is a registered trademark of Cytiva
ÄKTA is a registered trademark of Cytiva

Código de clase de almacenamiento

11 - Combustible Solids

Clase de riesgo para el agua (WGK)

WGK 3

Punto de inflamabilidad (°F)

Not applicable

Punto de inflamabilidad (°C)

Not applicable


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