Bactériologie
La bactériologie en tant que discipline s'intéresse à tous les aspects des espèces bactériennes : génétique, structure, physiologie, comportement, pathogénicité, écologie et évolution. Les examens bactériologiques sont essentiels en diagnostic clinique et en contrôle qualité industriel. L'application de la microscopie en bactériologie implique la coloration des micro-organismes avec les méthodes adéquates (p. ex. coloration de Gram) pour déterminer la classification des bactéries ou détecter les mycobactéries.
Les colorants pour le diagnostic bactériologique courant et leurs utilisations
Coloration de Gram
La coloration de Gram est une technique de coloration essentielle en bactériologie, utilisée pour différencier les bactéries à Gram positif des bactéries à Gram négatif. Dans cette méthode, la différenciation est réalisée car les bactéries à Gram positif retiennent le colorant cristal violet en raison de la présence d'une fine couche de peptidoglycane dans la paroi de leurs cellules.
Les bactéries à Gram négatif sont quant à elles décolorées par un solvant organique et virent au rose-orangé lors de la contre-coloration, ce qui est attribué à une paroi peptidoglycane plus fine. Les réactifs requis pour cette procédure de coloration en plusieurs étapes incluent le cristal violet (colorant primaire), un colorant d'aniline, une solution iodée (mordant) et la safranine orange (colorant secondaire) ou des contre-colorants à la fuchsine phéniquée.
Coloration des mycobactéries
Le diagnostic précoce d'une infection mycobactérienne est critique, car les bactéries acido-alcoolo-résistantes sont hautement pathogènes et responsables de maladies graves, telles que la tuberculose. Diverses solutions de coloration sont disponibles pour la détection de ces bactéries pathogènes dans les cultures de tissus histologiques et les frottis bactériologiques. Des méthodes de détection en fluorescence sont utilisées avec la technique de coloration de Ziehl-Neelsen, par le biais de lames traitées à la chaleur (coloration à chaud) ou d'un traitement ne nécessitant pas de chauffage (coloration à froid). Cette technique de coloration différentielle utilise le composé phénolique liposoluble appelé fuchsine phéniquée comme colorant primaire et le contre-colorant vert de malachite.
Coloration des trichomonades
Les parasites Trichomonas vaginalis sont particulièrement communs dans le matériel gynécologique, tel que les frottis vaginaux et les sédiments urinaires, et provoquent la maladie sexuellement transmissible non virale la plus commune, la trichomonase. Divers colorants, comme le colorant Giemsa et l'acridine orange, sont utilisés lors d'un examen avec montage humide pour le diagnostic au microscope de Trichomonas vaginalis.
Applications de la bactériologie dans d'autres domaines
Dans l'industrie agro-alimentaire, des bactéries lactiques telles que Lactobacillus, Lactococcus et Streptococcus sont utilisées dans la fabrication des produits laitiers, tels que le fromage, le babeurre et le yaourt. Des fermentations bactériennes sont utilisées dans le traitement de boissons, telles que le thé et le café. Dans le domaine en pleine expansion de la santé du microbiome intestinal, plusieurs espèces bactériennes sont utilisées dans des suppléments de probiotiques pour réduire l'inflammation et améliorer la fonction intestinale. Des bactéries sont également utilisées dans l'industrie pharmaceutique en recherche et production d'antibiotiques, notamment des tétracyclines, de l'érythromycine par Streptomyces et de la bacitracine par Bacillus.
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