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  • Characterization of the Human Transcription Elongation Factor Rtf1: Evidence for Nonoverlapping Functions of Rtf1 and the Paf1 Complex.

Characterization of the Human Transcription Elongation Factor Rtf1: Evidence for Nonoverlapping Functions of Rtf1 and the Paf1 Complex.

Molecular and cellular biology (2015-07-29)
Qing-Fu Cao, Junichi Yamamoto, Tomoyasu Isobe, Shumpei Tateno, Yuki Murase, Yexi Chen, Hiroshi Handa, Yuki Yamaguchi
ZUSAMMENFASSUNG

Restores TBP function 1 (Rtf1) is generally considered to be a subunit of the Paf1 complex (PAF1C), a multifunctional protein complex involved in histone modification and transcriptional or posttranscriptional regulation. Rtf1, however, is not stably associated with the PAF1C in most species except Saccharomyces cerevisiae, and its biochemical functions are not well understood. Here, we show that human Rtf1 is a transcription elongation factor that may function independently of the PAF1C. Rtf1 requires "Rtf1 coactivator" activity, which is most likely unrelated to the PAF1C or DSIF, for transcriptional activation in vitro. A mutational study revealed that the Plus3 domain of human Rtf1 is critical for its coactivator-dependent function. Transcriptome sequencing (RNA-seq) and chromatin immunoprecipitation studies in HeLa cells showed that Rtf1 and the PAF1C play distinct roles in regulating the expression of a subset of genes. Moreover, contrary to the finding in S. cerevisiae, the PAF1C was apparently recruited to the genes examined in an Rtf1-independent manner. The present study establishes a role for human Rtf1 as a transcription elongation factor and highlights the similarities and differences between the S. cerevisiae and human Rtf1 proteins.

MATERIALIEN
Produktnummer
Marke
Produktbeschreibung

Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, ACS reagent, 99.0-100.5%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid, for molecular biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, puriss., meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, FCC, E508, 99-100.5% (AT), ≤0.0001% Al
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, for molecular biology, ≥99.0%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid -Lösung, 5 M in H2O, BioReagent, for molecular biology, suitable for cell culture
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid -Lösung, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, powder, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, ≥99.0%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, ReagentPlus®, ≥99.0%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
SAFC
Natriumchlorid -Lösung, 5 M
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid -Lösung, BioUltra, for molecular biology, ~1 M in H2O
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, anhydrous, free-flowing, Redi-Dri, ACS reagent, ≥99%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid -Lösung, BioUltra, for molecular biology, ~5 M in H2O
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, puriss. p.a., ≥99.5% (AT)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (AT)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid, BioUltra, for molecular biology, ≥99.5% (AT)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid, BioXtra, ≥99.5% (AT)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, anhydrous, free-flowing, Redi-Dri, ReagentPlus®, ≥99%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, 99.999% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, ≥99.99% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, BioXtra, ≥99.0%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid-35Cl, 99 atom % 35Cl
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumchlorid -Lösung, 0.85%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid -Lösung, 0.075 M, sterile-filtered, BioXtra, suitable for cell culture
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, AnhydroBeads, −10 mesh, 99.999% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Kaliumchlorid, AnhydroBeads, −10 mesh, 99.99% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.